More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2164 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2164  alanine racemase domain protein  100 
 
 
219 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  45.41 
 
 
227 aa  181  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  43.68 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  44.5 
 
 
247 aa  178  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  43.98 
 
 
247 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  40 
 
 
218 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  39.73 
 
 
250 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  40.47 
 
 
226 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  45.08 
 
 
226 aa  175  4e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  44.21 
 
 
230 aa  175  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  40 
 
 
226 aa  175  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  44.71 
 
 
225 aa  174  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  40.64 
 
 
219 aa  174  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  40.28 
 
 
218 aa  174  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1285  alanine racemase domain-containing protein  42.41 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  43.98 
 
 
227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  39.81 
 
 
225 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  43.68 
 
 
220 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  42.93 
 
 
244 aa  170  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5034  alanine racemase domain-containing protein  43.81 
 
 
214 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0844  hypothetical protein  42.11 
 
 
221 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  44.21 
 
 
221 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  42.63 
 
 
221 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  42.11 
 
 
221 aa  167  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  43.46 
 
 
219 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  42.92 
 
 
224 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  41.88 
 
 
250 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  40.28 
 
 
219 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  40.29 
 
 
217 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  42.63 
 
 
219 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  43.46 
 
 
232 aa  164  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  38.16 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  42.63 
 
 
228 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0335  alanine racemase domain protein  43.46 
 
 
230 aa  162  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00537658 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  39.63 
 
 
219 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  41.45 
 
 
219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  41.98 
 
 
225 aa  161  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  42.78 
 
 
226 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  40 
 
 
242 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0628  alanine racemase domain protein  40.21 
 
 
248 aa  158  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0643141 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  41.05 
 
 
191 aa  152  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2952  hypothetical protein  37.7 
 
 
225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  38.42 
 
 
221 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  41.87 
 
 
216 aa  148  8e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  40.2 
 
 
238 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2054  alanine racemase domain-containing protein  38.1 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0733965  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  38.69 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  38.69 
 
 
238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  38.89 
 
 
237 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  40.39 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  37.69 
 
 
233 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  38.5 
 
 
239 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  38.71 
 
 
227 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  38.5 
 
 
232 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3450  alanine racemase domain protein  38.5 
 
 
237 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  38.5 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  38 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  38.69 
 
 
232 aa  135  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  37.5 
 
 
230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  38.19 
 
 
232 aa  134  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  36.22 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  35.89 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  36.95 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  39.9 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  35.65 
 
 
231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  36.44 
 
 
231 aa  132  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  34.93 
 
 
227 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  38.38 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  38.38 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  35.68 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  38.89 
 
 
232 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  37.81 
 
 
237 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  36.74 
 
 
222 aa  128  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  33.64 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  36.7 
 
 
241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  35.81 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  37.25 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  35.38 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  38.6 
 
 
233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03298  alanine racemase domain protein  36.87 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  37.56 
 
 
248 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  37.37 
 
 
244 aa  126  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  39.3 
 
 
241 aa  126  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  37.25 
 
 
230 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  35.43 
 
 
255 aa  126  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  34.95 
 
 
234 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  36.14 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  38.69 
 
 
234 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  36.13 
 
 
213 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  35.86 
 
 
226 aa  124  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  34.85 
 
 
235 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2190  hypothetical cytosolic protein  37.81 
 
 
228 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.724398  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2216  hypothetical protein  37.81 
 
 
228 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000309161  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  36.89 
 
 
233 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  36.45 
 
 
236 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  34.78 
 
 
212 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  35.64 
 
 
231 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  35.12 
 
 
229 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  35.96 
 
 
236 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  35.15 
 
 
237 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>