88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2114 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2114  OsmC family protein  100 
 
 
157 aa  326  6e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0029587  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4927  OsmC family protein  62.58 
 
 
158 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5482  OsmC family protein  62.58 
 
 
158 aa  198  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007254 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0037  OsmC-like protein  58.82 
 
 
158 aa  196  9e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4740  OsmC-like protein  64.86 
 
 
157 aa  194  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0038  OsmC-like protein  61.29 
 
 
162 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1958  OsmC-like protein  62.42 
 
 
156 aa  194  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000431204  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4769  OsmC family protein  61.74 
 
 
158 aa  194  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0752718  hitchhiker  0.00196511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1947  hypothetical protein  61.64 
 
 
160 aa  189  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0572068  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4583  OsmC family protein  64.43 
 
 
158 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000769808 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1310  OsmC family protein  60.81 
 
 
165 aa  187  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2001  hypothetical protein  61.07 
 
 
158 aa  187  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650106  normal  0.0215545 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1692  OsmC family protein  61.9 
 
 
158 aa  187  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0907  OsmC family protein  58 
 
 
157 aa  185  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.055937 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5646  OsmC family protein  63.09 
 
 
158 aa  184  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0186401  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5213  OsmC-like protein  63.09 
 
 
158 aa  184  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2862  OsmC family protein  57.89 
 
 
183 aa  182  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.685422  normal  0.837352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7165  OsmC family protein  55.19 
 
 
155 aa  180  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.182852  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2938  OsmC family protein  58.5 
 
 
228 aa  180  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895882  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0548  OsmC family protein  58.55 
 
 
163 aa  180  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474457  normal  0.130238 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0713  redox protein  50.65 
 
 
157 aa  178  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2753  OsmC family protein  57.82 
 
 
200 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3039  OsmC family protein  55.1 
 
 
157 aa  177  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.557785  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0455  OsmC family protein  51.97 
 
 
158 aa  173  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140043  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2755  OsmC family protein  57.05 
 
 
156 aa  173  9e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2411  OsmC family protein  52.98 
 
 
159 aa  163  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.405429  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20080  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  52.32 
 
 
167 aa  161  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0523786  normal  0.777865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4367  OsmC family protein  52.29 
 
 
156 aa  160  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2177  OsmC family protein  52.5 
 
 
168 aa  159  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2165  OsmC family protein  50 
 
 
157 aa  153  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000769613 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1948  OsmC family protein  48.7 
 
 
169 aa  152  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14522  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3983  OsmC family protein  54.67 
 
 
164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.31351  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1124  OsmC family protein  39.61 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  43.92 
 
 
357 aa  124  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2559  OsmC family protein  37.18 
 
 
158 aa  90.9  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0740791  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4479  OsmC-like protein  38.16 
 
 
156 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0450  OsmC family protein  34.87 
 
 
153 aa  87.8  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3388  OsmC-like protein  37.91 
 
 
162 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2509  OsmC family protein  36.6 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.122372  normal  0.0137293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1969  OsmC family protein  41.38 
 
 
158 aa  85.5  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1731  OsmC family protein  37.58 
 
 
155 aa  85.1  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.372414  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1351  OsmC family protein  36.6 
 
 
157 aa  84.7  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0147839  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1165  OsmC family protein  39.22 
 
 
150 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447752  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1219  OsmC family protein  28.99 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2253  OsmC family protein  47.96 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0722001  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1915  OsmC family protein  35.71 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10754  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0026  OsmC family protein  34.44 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4637  OsmC family protein  36.24 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4270  OsmC family protein  36.84 
 
 
150 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4785  OsmC family protein  36.84 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.577145 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2718  OsmC family protein  35.38 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2693  OsmC family protein  32.9 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393695  normal  0.105076 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1543  OsmC family protein  30.52 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307214  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1593  OsmC family protein  33.12 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3312  OsmC family protein  30 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325199 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1006  OsmC/Ohr family protein  33.55 
 
 
161 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0173  hypothetical protein  33.55 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0475  hypothetical protein  33.55 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0907  hypothetical protein  33.55 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361211  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1435  hypothetical protein  33.55 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.726486  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0383  OsmC-like protein  33.55 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1846  hypothetical protein  33.55 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1081  OsmC family protein  31.13 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.192892  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1921  OsmC family protein  35.53 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0276475 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1936  OsmC/Ohr family protein  32.9 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345446  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1236  OsmC family protein  31.06 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208617  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2414  OsmC family protein  31.3 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0411  OsmC family protein  33.79 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3409  OsmC/Ohr family protein  28.78 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1225  OsmC-like protein  30 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1311  OsmC family protein  28.78 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.406507  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1234  OsmC family protein  28.78 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.353778  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2730  OsmC family protein  28.78 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1278  OsmC family protein  28.78 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.553588  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1336  OsmC family protein  30.92 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1216  OsmC family protein  28.78 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1145  OsmC family protein  28.78 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366045  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3079  OsmC family protein  28.06 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.448993  hitchhiker  0.0016345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2199  OsmC family protein  36.3 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.474196 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1146  OsmC family protein  28.06 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240293  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0982  OsmC-like protein  30.5 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276623  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1172  OsmC-like protein  31.15 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.286311  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3515  OsmC family protein  31.79 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2063  hypothetical protein  29.23 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597173 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3314  OsmC family protein  31.58 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06163  hypothetical protein  32.26 
 
 
155 aa  60.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000353  predicted redox protein  33.85 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1457  OsmC-like protein  25.66 
 
 
144 aa  47.4  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>