More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2109 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
233 aa  472  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  51.32 
 
 
228 aa  268  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  51.32 
 
 
228 aa  268  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  57.33 
 
 
228 aa  268  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  60.54 
 
 
234 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  56.25 
 
 
232 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  57.08 
 
 
227 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  56.25 
 
 
232 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  57.08 
 
 
227 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  57.08 
 
 
227 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  56.25 
 
 
242 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  57.59 
 
 
233 aa  254  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  55.8 
 
 
232 aa  254  7e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  56.25 
 
 
691 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  58.41 
 
 
238 aa  254  8e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  55.8 
 
 
242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  55.51 
 
 
232 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  55.8 
 
 
242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  56.31 
 
 
229 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  56.28 
 
 
225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.63 
 
 
225 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  47.77 
 
 
231 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  53.74 
 
 
224 aa  232  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  57.87 
 
 
224 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  59.07 
 
 
226 aa  230  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.62 
 
 
227 aa  225  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.75 
 
 
227 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.16 
 
 
227 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  53.64 
 
 
229 aa  221  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.14 
 
 
242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  49.55 
 
 
285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.75 
 
 
230 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  54.31 
 
 
220 aa  215  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  53.92 
 
 
225 aa  215  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  50.68 
 
 
242 aa  214  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  47.16 
 
 
241 aa  214  9e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  49.13 
 
 
239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  49.76 
 
 
276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  56.16 
 
 
227 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.23 
 
 
276 aa  208  7e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  53.03 
 
 
261 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  48.65 
 
 
232 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.22 
 
 
231 aa  204  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  47.19 
 
 
234 aa  201  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.19 
 
 
234 aa  201  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  48.2 
 
 
228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  48.2 
 
 
228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  46.32 
 
 
279 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  52 
 
 
262 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5977  ThiJ/PfpI  47.53 
 
 
228 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  46.88 
 
 
228 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  46.88 
 
 
228 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.27 
 
 
239 aa  189  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  44.6 
 
 
232 aa  188  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  48.7 
 
 
243 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  50.26 
 
 
212 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.31 
 
 
234 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  46.88 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.83 
 
 
234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.73 
 
 
231 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.54 
 
 
277 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.22 
 
 
232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  53.89 
 
 
201 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4536  DJ-1/PfpI family protein  51.23 
 
 
261 aa  175  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.89 
 
 
232 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.93 
 
 
246 aa  164  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.36 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.68 
 
 
245 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  44.68 
 
 
245 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.68 
 
 
245 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  45.26 
 
 
233 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.11 
 
 
231 aa  151  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  43.41 
 
 
222 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  39.53 
 
 
326 aa  141  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 
284 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1771  DJ-1/PfpI family protein  43.13 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  49.67 
 
 
201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5955  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.5 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2029  putative isonitrile hydratase  43.13 
 
 
255 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.53 
 
 
284 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0688  putative isonitrile hydratase  43.13 
 
 
246 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1054  DJ-1/PfpI family protein  43.13 
 
 
255 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0761  DJ-1/PfpI family protein  43.13 
 
 
255 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0777  putative isonitrile hydratase  43.13 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  39.07 
 
 
284 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.07 
 
 
284 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.42 
 
 
210 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  42.13 
 
 
214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2062  DJ-1/PfpI family protein  42.65 
 
 
636 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.595101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.14 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.06 
 
 
233 aa  131  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.22 
 
 
207 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  40.8 
 
 
199 aa  123  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.12 
 
 
226 aa  122  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  36.04 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  38.24 
 
 
207 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.68 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  34.74 
 
 
297 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>