More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2095 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
447 aa  890    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  80.8 
 
 
448 aa  714    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  62.13 
 
 
452 aa  548  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  51.7 
 
 
461 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  51.57 
 
 
449 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  53.26 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  46.28 
 
 
465 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  45.33 
 
 
465 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  45.39 
 
 
448 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  45.39 
 
 
448 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  43.88 
 
 
441 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  43.55 
 
 
451 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  42.7 
 
 
449 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  44.34 
 
 
448 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  46.55 
 
 
448 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  46.37 
 
 
457 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  46.76 
 
 
458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  45.41 
 
 
447 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  42.19 
 
 
452 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 
452 aa  349  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  47.16 
 
 
448 aa  348  8e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  43.69 
 
 
452 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  45.59 
 
 
452 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  43.08 
 
 
449 aa  346  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  47.16 
 
 
448 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  45.34 
 
 
452 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2340  4-hydroxybenzoate transporter  47.16 
 
 
449 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.934409  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  40.13 
 
 
454 aa  342  8e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 
451 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  41.65 
 
 
454 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  41.53 
 
 
452 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  42.63 
 
 
447 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  42.96 
 
 
452 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  42.96 
 
 
452 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  42.96 
 
 
452 aa  335  7e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  43.09 
 
 
452 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  42.26 
 
 
452 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  44.95 
 
 
449 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  42.86 
 
 
450 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  42.86 
 
 
446 aa  331  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  41.94 
 
 
453 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  44.08 
 
 
454 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  42.07 
 
 
453 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  43.18 
 
 
456 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  38.85 
 
 
449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  40.05 
 
 
458 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  43.58 
 
 
451 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  42.79 
 
 
455 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  41.86 
 
 
459 aa  319  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  41.71 
 
 
453 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  41.3 
 
 
453 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  41.3 
 
 
453 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2124  benzoate transport  47.42 
 
 
449 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798093  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  41.57 
 
 
457 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  43.2 
 
 
459 aa  313  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0050  4-hydroxybenzoate transporter  44.19 
 
 
451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1488  4-hydroxybenzoate transporter  44.19 
 
 
451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1205  4-hydroxybenzoate transporter  44.19 
 
 
451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0061  4-hydroxybenzoate transporter  44.19 
 
 
451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  41.23 
 
 
458 aa  310  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  39.61 
 
 
468 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0072  4-hydroxybenzoate transporter  43.95 
 
 
451 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279221  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  42.31 
 
 
460 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0059  4-hydroxybenzoate transporter  43.18 
 
 
451 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1558  4-hydroxybenzoate transporter  43.18 
 
 
451 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  42.49 
 
 
449 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  37.83 
 
 
452 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  37.59 
 
 
452 aa  293  6e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  38.3 
 
 
452 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  38.3 
 
 
452 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  38.3 
 
 
452 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  38.06 
 
 
452 aa  289  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0807  major facilitator transporter  42.01 
 
 
386 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  39.05 
 
 
453 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32660  MFS family transporter  41.04 
 
 
448 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00466329  hitchhiker  0.0000329882 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  42.28 
 
 
458 aa  277  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  38.53 
 
 
452 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  39.38 
 
 
458 aa  276  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  36.18 
 
 
452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  32.71 
 
 
438 aa  257  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  33.1 
 
 
475 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3941  major facilitator transporter  36.1 
 
 
449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.939508 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  33.72 
 
 
453 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  33.72 
 
 
453 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  33.87 
 
 
453 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4567  4-hydroxybenzoate transporter  37.4 
 
 
458 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0165748  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  32.95 
 
 
452 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  32.95 
 
 
452 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  32.94 
 
 
453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  38.71 
 
 
441 aa  243  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  32.47 
 
 
450 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  31.41 
 
 
455 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  31.95 
 
 
451 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  31.95 
 
 
451 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  31.95 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  31.95 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  31.95 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  31.95 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  31.95 
 
 
451 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  30.8 
 
 
461 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>