188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2002 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  61.88 
 
 
554 aa  705    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  61.03 
 
 
554 aa  711    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  100 
 
 
549 aa  1126    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  72.13 
 
 
558 aa  821    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  54.45 
 
 
557 aa  551  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  48.04 
 
 
568 aa  501  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  44.53 
 
 
560 aa  472  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  32.43 
 
 
562 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  32.5 
 
 
565 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  32.54 
 
 
562 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  32.36 
 
 
562 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  31.28 
 
 
569 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  33.02 
 
 
570 aa  302  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.97 
 
 
585 aa  268  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.6 
 
 
573 aa  230  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.65 
 
 
592 aa  227  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.84 
 
 
575 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  31.1 
 
 
583 aa  219  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  31.51 
 
 
578 aa  219  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  30.78 
 
 
582 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.38 
 
 
565 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  30.13 
 
 
561 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.59 
 
 
584 aa  217  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.09 
 
 
562 aa  216  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  29.09 
 
 
562 aa  216  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  29.81 
 
 
586 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  30.45 
 
 
586 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.39 
 
 
586 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  30.82 
 
 
583 aa  209  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.39 
 
 
593 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.43 
 
 
597 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  31.19 
 
 
590 aa  206  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  29.27 
 
 
585 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.74 
 
 
594 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  29.08 
 
 
585 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  28.88 
 
 
568 aa  203  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  30.08 
 
 
584 aa  203  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  27.95 
 
 
562 aa  203  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.04 
 
 
563 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.95 
 
 
562 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.85 
 
 
608 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.03 
 
 
592 aa  202  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  27.95 
 
 
562 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  30.93 
 
 
590 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.52 
 
 
591 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  29.26 
 
 
562 aa  198  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.78 
 
 
580 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  27.64 
 
 
578 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.55 
 
 
595 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.5 
 
 
580 aa  196  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  28.8 
 
 
564 aa  196  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  29.25 
 
 
588 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.22 
 
 
582 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  29.83 
 
 
558 aa  195  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.13 
 
 
591 aa  194  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  29.84 
 
 
602 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  30.57 
 
 
575 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  28.04 
 
 
584 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  28.78 
 
 
539 aa  190  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.33 
 
 
563 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.4 
 
 
568 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.78 
 
 
591 aa  190  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  29.49 
 
 
570 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.21 
 
 
574 aa  181  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  27.26 
 
 
581 aa  181  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.94 
 
 
585 aa  177  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.18 
 
 
610 aa  176  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.26 
 
 
581 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  28.46 
 
 
572 aa  172  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  27.37 
 
 
574 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  27.06 
 
 
570 aa  168  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.96 
 
 
581 aa  164  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  25.62 
 
 
554 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  25.62 
 
 
551 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  25.62 
 
 
554 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  25.62 
 
 
558 aa  157  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  25.62 
 
 
558 aa  157  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  24.63 
 
 
550 aa  156  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  26.16 
 
 
520 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  25.33 
 
 
554 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.95 
 
 
570 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.38 
 
 
566 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  24.14 
 
 
553 aa  143  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.9 
 
 
593 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2045  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  24.5 
 
 
513 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102664  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  24.04 
 
 
553 aa  140  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  27.8 
 
 
565 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.37 
 
 
560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  23.78 
 
 
590 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.36 
 
 
559 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  23.22 
 
 
590 aa  130  7.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  21.4 
 
 
566 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.95 
 
 
561 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  23.75 
 
 
588 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.44 
 
 
587 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0745  haemolysin secretion/activation protein ShlB/FhaC/HecB  24.67 
 
 
547 aa  107  8e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  23.6 
 
 
585 aa  105  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  21.24 
 
 
556 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.31 
 
 
554 aa  99.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  22.92 
 
 
553 aa  98.6  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>