More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1972 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1972  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
156 aa  332  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2214  methionine-R-sulfoxide reductase  76.81 
 
 
138 aa  236  6.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.399657  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2095  methionine sulfoxide reductase B  76.15 
 
 
137 aa  215  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000449437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2350  methionine sulfoxide reductase B  76.15 
 
 
137 aa  215  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167897  normal  0.0377518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1986  methionine sulfoxide reductase B  76.15 
 
 
137 aa  215  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000131447  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2727  methionine sulfoxide reductase B  76 
 
 
137 aa  207  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00340114  hitchhiker  0.000973633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2262  methionine sulfoxide reductase B  69.78 
 
 
139 aa  207  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00190122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1966  methionine sulfoxide reductase B  76 
 
 
139 aa  207  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0169175  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1884  methionine sulfoxide reductase B  65.94 
 
 
137 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000227022  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  65.94 
 
 
137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1402  methionine sulfoxide reductase B  65.94 
 
 
137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.0051199 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  65.94 
 
 
137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  65.94 
 
 
137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01747  methionine sulfoxide reductase B  65.22 
 
 
137 aa  192  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0193587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  65.22 
 
 
137 aa  192  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  65.22 
 
 
137 aa  192  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  65.22 
 
 
137 aa  192  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  65.22 
 
 
137 aa  192  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01735  hypothetical protein  65.22 
 
 
137 aa  192  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1863  methionine sulfoxide reductase B  65.22 
 
 
137 aa  192  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000150257  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  68.38 
 
 
137 aa  192  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1854  methionine sulfoxide reductase B  65.22 
 
 
137 aa  192  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0487085  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  64.17 
 
 
136 aa  164  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1584  methionine sulfoxide reductase B  63.79 
 
 
147 aa  161  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000628294  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  64.66 
 
 
166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1850  methionine sulfoxide reductase B  60.33 
 
 
134 aa  159  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  56.67 
 
 
133 aa  147  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  55.97 
 
 
132 aa  147  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  56.72 
 
 
132 aa  146  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  58.12 
 
 
131 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5350  methionine sulfoxide reductase B  55.08 
 
 
147 aa  141  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  57.02 
 
 
148 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2441  methionine sulfoxide reductase B  56.9 
 
 
148 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.660981 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5573  methionine sulfoxide reductase B  55.08 
 
 
147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139871  normal  0.0985113 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3401  methionine sulfoxide reductase B  51.85 
 
 
141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2803  methionine sulfoxide reductase B  52.34 
 
 
149 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0125  methionine sulfoxide reductase B  53.91 
 
 
147 aa  137  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155409  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  54.17 
 
 
133 aa  136  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3364  methionine sulfoxide reductase B  52.03 
 
 
148 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  53.78 
 
 
137 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  52.5 
 
 
132 aa  135  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1932  methionine-R-sulfoxide reductase  52.07 
 
 
143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939518  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2139  methionine-R-sulfoxide reductase  54.39 
 
 
143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.142771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2966  methionine sulfoxide reductase B  58.33 
 
 
148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  52.8 
 
 
142 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  54.31 
 
 
127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2298  methionine-R-sulfoxide reductase  54.39 
 
 
161 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.52536  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2337  methionine-R-sulfoxide reductase  54.39 
 
 
151 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2458  methionine-R-sulfoxide reductase  54.39 
 
 
143 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5210  protein-methionine-S-oxide reductase  52.07 
 
 
143 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304973 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  55.17 
 
 
133 aa  134  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  48.46 
 
 
134 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1365  methionine-R-sulfoxide reductase  54.39 
 
 
143 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  49.19 
 
 
150 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1205  methionine-R-sulfoxide reductase  53.51 
 
 
151 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  55.26 
 
 
133 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1441  methionine-R-sulfoxide reductase  53.51 
 
 
143 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3373  methionine-R-sulfoxide reductase  53.51 
 
 
143 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2873  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  45.11 
 
 
348 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1932  methionine-R-sulfoxide reductase  53.51 
 
 
143 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6170  protein-methionine-S-oxide reductase  51.24 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1909  methionine-R-sulfoxide reductase  51.24 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  50.39 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4326  methionine sulfoxide reductase B  52.54 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  50.39 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  48.84 
 
 
128 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0446  methionine sulfoxide reductase B  50.81 
 
 
146 aa  131  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.342631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0390  methionine sulfoxide reductase B  50.81 
 
 
146 aa  131  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.504869  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1897  methionine-R-sulfoxide reductase  50.41 
 
 
143 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  52.5 
 
 
131 aa  130  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  54.39 
 
 
135 aa  130  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  49.19 
 
 
321 aa  130  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2143  methionine sulfoxide reductase B  54.47 
 
 
149 aa  130  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
321 aa  130  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
321 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50 
 
 
321 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  55.26 
 
 
138 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  49.59 
 
 
321 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50 
 
 
321 aa  130  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50 
 
 
321 aa  130  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
321 aa  130  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
321 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3070  methionine sulfoxide reductase B  48.44 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2329  methionine sulfoxide reductase B  52.14 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  51.64 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5091  protein-methionine-S-oxide reductase  48.78 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5179  methionine-R-sulfoxide reductase  48.78 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1827  methionine-R-sulfoxide reductase  52.63 
 
 
143 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186679  normal  0.561809 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  55.26 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  48.84 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  48.41 
 
 
142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1106  methionine-R-sulfoxide reductase  48.44 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  54.39 
 
 
146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  50.41 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  49.17 
 
 
321 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  49.17 
 
 
321 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  53.51 
 
 
140 aa  128  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  47.29 
 
 
135 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  41.35 
 
 
337 aa  128  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  52.17 
 
 
142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>