More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1745 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  100 
 
 
201 aa  408  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  88.06 
 
 
201 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  84.58 
 
 
201 aa  362  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  84.08 
 
 
201 aa  360  9e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  80.1 
 
 
201 aa  337  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  79.6 
 
 
201 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  79.6 
 
 
201 aa  333  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  79.6 
 
 
201 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  75.12 
 
 
201 aa  322  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  73.63 
 
 
201 aa  317  5e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  73.63 
 
 
201 aa  317  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  73.63 
 
 
201 aa  317  5e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  73.13 
 
 
201 aa  316  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  73.13 
 
 
201 aa  316  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  72.64 
 
 
201 aa  315  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  72.64 
 
 
201 aa  313  8e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  72.64 
 
 
201 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  72.64 
 
 
201 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  77.6 
 
 
201 aa  306  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  77.6 
 
 
201 aa  306  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  77.6 
 
 
201 aa  306  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  77.6 
 
 
201 aa  306  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  77.05 
 
 
201 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  62.44 
 
 
232 aa  272  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  60.71 
 
 
196 aa  247  9e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  60 
 
 
197 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  58.5 
 
 
197 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  56.5 
 
 
197 aa  239  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  58.29 
 
 
198 aa  235  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159762  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  58.29 
 
 
194 aa  235  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  57.79 
 
 
198 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  58.29 
 
 
213 aa  231  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0319  azoreductase  57.79 
 
 
198 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000641081  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0321  azoreductase  57.79 
 
 
198 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292706  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3703  azoreductase  57.79 
 
 
198 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000384963  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  57.29 
 
 
198 aa  231  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4396  azoreductase  56.5 
 
 
198 aa  230  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0316  azoreductase  57.29 
 
 
198 aa  229  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001628  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0423  azoreductase  56.99 
 
 
198 aa  223  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  54.17 
 
 
197 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  54.27 
 
 
199 aa  210  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  53.81 
 
 
206 aa  209  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.26 
 
 
199 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  50.75 
 
 
199 aa  201  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.75 
 
 
199 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.75 
 
 
204 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.75 
 
 
199 aa  197  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.75 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  52.41 
 
 
198 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  52.94 
 
 
198 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.94 
 
 
198 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  52.94 
 
 
198 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  49.24 
 
 
213 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  48.73 
 
 
213 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  46.46 
 
 
198 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  46.46 
 
 
198 aa  188  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  46.46 
 
 
237 aa  188  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  46.46 
 
 
237 aa  188  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  46.46 
 
 
237 aa  188  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  46.46 
 
 
237 aa  188  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  46.46 
 
 
237 aa  188  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.27 
 
 
198 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  47.45 
 
 
198 aa  187  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.1 
 
 
198 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  51.1 
 
 
198 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  46.94 
 
 
199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2923  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  47.98 
 
 
199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660673  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.35 
 
 
198 aa  182  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.82 
 
 
209 aa  182  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  48.35 
 
 
198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.35 
 
 
198 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4167  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.72 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.2 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  45.41 
 
 
203 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0682  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.01 
 
 
204 aa  155  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.71 
 
 
204 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.71 
 
 
204 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.31 
 
 
209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.33 
 
 
197 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  42.78 
 
 
202 aa  150  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.09 
 
 
207 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.82 
 
 
207 aa  148  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01015  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41.5 
 
 
200 aa  148  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000114134  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.85 
 
 
208 aa  147  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.85 
 
 
208 aa  147  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.76 
 
 
216 aa  147  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  43.96 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  42.55 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.28 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  43.96 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  41.62 
 
 
217 aa  144  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  44.09 
 
 
203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  43.41 
 
 
203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.5 
 
 
207 aa  144  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  42.54 
 
 
202 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.09 
 
 
206 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.4 
 
 
202 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40.1 
 
 
213 aa  142  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  39.5 
 
 
214 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.5 
 
 
214 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>