176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1695 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1695  pyridoxamine kinase  100 
 
 		 286 aa  595  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1728  pyridoxamine kinase  86.36 
 
 		 286 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2660  pyridoxamine kinase  80.77 
 
 		 286 aa  485  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2376  pyridoxamine kinase  80.77 
 
 		 286 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2220  pyridoxamine kinase  77.62 
 
 		 286 aa  458  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1774  pyridoxamine kinase  76.57 
 
 		 286 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1882  pyridoxamine kinase  76.92 
 
 		 286 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1560  pyridoxamine kinase  73.43 
 
 		 286 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.706911  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1547  pyridoxamine kinase  73.43 
 
 		 286 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.473555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1620  pyridoxamine kinase  73.08 
 
 		 286 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.122629  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1724  pyridoxamine kinase  73.08 
 
 		 286 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000809098  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01606  pyridoxine kinase  72.73 
 
 		 287 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.285495  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2004  pyridoxal kinase  72.73 
 
 		 286 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00305997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01596  hypothetical protein  72.73 
 
 		 287 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.262345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2348  pyridoxamine kinase  72.73 
 
 		 286 aa  437  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.205502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1712  pyridoxamine kinase  72.73 
 
 		 286 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0772726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1846  pyridoxamine kinase  72.73 
 
 		 286 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000179286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1993  pyridoxamine kinase  72.73 
 
 		 286 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0266148 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1563  pyridoxamine kinase  72.73 
 
 		 286 aa  437  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1812  pyridoxamine kinase  71.33 
 
 		 286 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000723622  decreased coverage  0.000302478 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4637  pyridoxal kinase  56.79 
 
 		 287 aa  334  7.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3913  pyridoxal kinase  56.79 
 
 		 287 aa  331  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5521  pyridoxal kinase  57.75 
 
 		 288 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2490  pyridoxamine kinase  56.25 
 
 		 289 aa  327  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5265  pyridoxamine kinase  57.3 
 
 		 290 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5357  pyridoxamine kinase  57.3 
 
 		 290 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72780  pyridoxamine kinase  56.34 
 
 		 288 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6318  pyridoxamine kinase  55.99 
 
 		 288 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5406  pyridoxamine kinase  56.94 
 
 		 290 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1799  pyridoxal kinase  57.95 
 
 		 287 aa  322  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803256  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5650  pyridoxamine kinase  57.3 
 
 		 290 aa  322  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2936  pyridoxal kinase  58.16 
 
 		 288 aa  322  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5135  pyridoxamine kinase  56.69 
 
 		 290 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.358825 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0933  pyridoxamine kinase  53.5 
 
 		 286 aa  321  9.000000000000001e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213613  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1541  pyridoxal kinase  57.45 
 
 		 312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5070  pyridoxamine kinase  57.04 
 
 		 288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2863  pyridoxal kinase  55.28 
 
 		 309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2857  pyridoxal kinase  54.93 
 
 		 287 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2743  pyridoxal kinase  54.93 
 
 		 287 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1745  pyridoxal kinase  54.93 
 
 		 309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0513133  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0582  pyridoxal kinase  54.58 
 
 		 287 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1763  pyridoxal kinase  54.23 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1049  pyridoxal kinase  53.52 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1046  pyridoxal kinase  53.52 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2802  pyridoxal kinase  54.58 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0918369  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4279  pyridoxal kinase  53.52 
 
 		 296 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2138  pyridoxal kinase  53.52 
 
 		 286 aa  299  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1143  pyridoxal kinase  53.87 
 
 		 286 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.779512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0688  pyridoxal kinase  53.52 
 
 		 286 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1167  pyridoxal kinase  53.52 
 
 		 286 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04836  pyridoxine kinase  48.58 
 
 		 289 aa  268  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001095  pyridoxal kinase  47.87 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0612  pyridoxamine kinase  45.61 
 
 		 290 aa  225  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0114  pyridoxal kinase  41.2 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2507  pyridoxal kinase  41.96 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4006  pyridoxamine kinase  43.66 
 
 		 293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2647  pyridoxamine kinase  41.9 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0468114  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0144  pyridoxamine kinase  42.91 
 
 		 299 aa  218  7.999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2897  pyridoxamine kinase  43.01 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1325  pyridoxamine kinase  41.99 
 
 		 282 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1429  pyridoxamine kinase  43.66 
 
 		 282 aa  215  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2472  pyridoxamine kinase  42.25 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4075  pyridoxamine kinase  41.2 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.122444  normal  0.8127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2670  pyridoxamine kinase  42.65 
 
 		 283 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2792  pyridoxamine kinase  41.94 
 
 		 283 aa  206  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.783971 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1345  pyridoxal kinase  40.14 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.019465  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1147  pyridoxamine kinase  44.37 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2218  pyridoxal kinase  38.79 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0357681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1059  pyridoxamine kinase  41.2 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976691  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5353  pyridoxal kinase  37.88 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0393  pyridoxal kinase  34.83 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2302  pyridoxal kinase  31.5 
 
 		 288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8828  predicted protein  32 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0571  pyridoxal kinase  34.69 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3138  pyridoxal kinase  33.21 
 
 		 288 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1830  pyridoxamine kinase  32.99 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1199  pyridoxal kinase  32.86 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1761  pyridoxamine kinase  32.99 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1145  pyridoxal kinase  31.97 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3224  pyridoxamine kinase  32.17 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1072  pyridoxamine kinase  32.64 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1437  pyridoxal kinase  34.4 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469194  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4457  pyridoxal kinase  32.2 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4141  pyridoxal kinase  32 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1604  pyridoxal kinase  30.63 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.871979 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2946  pyridoxal kinase  30.57 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0674274  normal  0.386186 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4114  pyridoxal kinase  30.98 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2881  pyridoxal kinase  34.07 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02318  pyridoxine kinase  28.68 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1243  pyridoxal kinase  28.68 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000355778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3649  pyridoxal kinase  29.21 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00538492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02279  hypothetical protein  28.68 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0311304  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3186  pyridoxamine kinase  30.74 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2553  pyridoxal kinase  28.68 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000166037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1260  pyridoxal kinase  28.68 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1920  pyridoxal kinase  31.23 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2705  pyridoxal kinase  27.92 
 
 		 283 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2791  pyridoxal kinase  27.92 
 
 		 283 aa  108  8.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04250  bud site selection-related protein, putative  41.88 
 
 		 402 aa  106  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203655  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34206  protein involved in bud site selection  32.73 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.121562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>