More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1628 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  100 
 
 		 155 aa  317  6e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  80 
 
 		 154 aa  256  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  70.78 
 
 		 154 aa  236  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  70.89 
 
 		 162 aa  229  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  72.61 
 
 		 157 aa  228  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  68.18 
 
 		 154 aa  225  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  68.18 
 
 		 154 aa  225  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  69.93 
 
 		 154 aa  221  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  69.93 
 
 		 154 aa  221  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  69.93 
 
 		 154 aa  221  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  69.93 
 
 		 154 aa  221  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  69.93 
 
 		 154 aa  221  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  66.01 
 
 		 154 aa  214  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  66.44 
 
 		 154 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  66.44 
 
 		 154 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  66.44 
 
 		 154 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  65.77 
 
 		 154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  68.53 
 
 		 143 aa  211  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  65.1 
 
 		 154 aa  210  5.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  67.14 
 
 		 154 aa  203  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  67.14 
 
 		 154 aa  203  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  67.14 
 
 		 154 aa  203  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  67.14 
 
 		 154 aa  203  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  51.94 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  42.11 
 
 		 171 aa  140  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  56.56 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  47.48 
 
 		 150 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  54.1 
 
 		 191 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  54.1 
 
 		 188 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  54.1 
 
 		 188 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  54.1 
 
 		 188 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  54.1 
 
 		 188 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  54.1 
 
 		 188 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  54.1 
 
 		 188 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  54.1 
 
 		 188 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  54.1 
 
 		 188 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  54.1 
 
 		 188 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  52.46 
 
 		 190 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  52.46 
 
 		 190 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  52.46 
 
 		 190 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  50.82 
 
 		 172 aa  133  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  50.82 
 
 		 194 aa  133  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  50.82 
 
 		 194 aa  133  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  52.46 
 
 		 147 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  52.46 
 
 		 147 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  54.1 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  51.64 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  52.46 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  51.64 
 
 		 194 aa  130  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  44.16 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  44.16 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 189 aa  127  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  46.36 
 
 		 154 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  44.16 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  45.65 
 
 		 183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  40.53 
 
 		 205 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  44.16 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000041841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  44.16 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  44.16 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156196 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  51.79 
 
 		 196 aa  124  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0391  NlpC/P60 family protein  47.54 
 
 		 195 aa  124  4.0000000000000003e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  51.26 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  51.26 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  52.73 
 
 		 179 aa  123  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  42.57 
 
 		 148 aa  120  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  39.74 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  40.52 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  39.07 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  40.76 
 
 		 333 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  40.38 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  43.2 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1825  lipoprotein NlpC  40.29 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  44.92 
 
 		 221 aa  104  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  39.57 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  47.71 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  37.8 
 
 		 208 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  44.38 
 
 		 233 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  40 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  41.74 
 
 		 173 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  41.09 
 
 		 302 aa  102  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 214 aa  101  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0941  NLP/P60 family protein  39.62 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  37.63 
 
 		 203 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  39.84 
 
 		 231 aa  98.6  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 191 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 188 aa  97.4  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  48.6 
 
 		 245 aa  97.4  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 193 aa  97.1  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  40.97 
 
 		 212 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  45.05 
 
 		 205 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 232 aa  97.1  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  45.05 
 
 		 193 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  40.97 
 
 		 214 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  38.17 
 
 		 174 aa  96.3  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  40.87 
 
 		 186 aa  95.9  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 207 aa  95.9  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  45.95 
 
 		 205 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 207 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  40.58 
 
 		 342 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>