More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1616 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1616  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 500 aa  1034    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59158  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1646  diguanylate phosphodiesterase  62.8 
 
 		 501 aa  670    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2920  diguanylate phosphodiesterase  34.63 
 
 		 511 aa  315  9e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14530  hypothetical protein  34.46 
 
 		 523 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2438  diguanylate phosphodiesterase  36.38 
 
 		 528 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1286  hypothetical protein  35.37 
 
 		 521 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3435  diguanylate phosphodiesterase  33.95 
 
 		 528 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2328  diguanylate phosphodiesterase  33.75 
 
 		 528 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01143  conserved inner membrane protein  34.68 
 
 		 507 aa  296  6e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01151  hypothetical protein  34.68 
 
 		 507 aa  296  6e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2501  diguanylate phosphodiesterase  33.26 
 
 		 528 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0965221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1264  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.48 
 
 		 521 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0322571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2458  diguanylate phosphodiesterase  34.68 
 
 		 521 aa  295  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.577985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1307  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.48 
 
 		 521 aa  294  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.654083  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2480  diguanylate phosphodiesterase  34.27 
 
 		 521 aa  292  8e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186873  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1798  diguanylate phosphodiesterase  35.64 
 
 		 520 aa  292  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199517  normal  0.66089 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1089  diguanylate phosphodiesterase  34.58 
 
 		 512 aa  289  7e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.725575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05545  sensory transduction protein kinase  31.84 
 
 		 506 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1983  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  35.43 
 
 		 486 aa  280  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.123377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2325  hypothetical protein  34.23 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.802767  hitchhiker  0.00255877 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0782  hypothetical protein  34 
 
 		 518 aa  227  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2474  hypothetical protein  34 
 
 		 518 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505117  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02106  hypothetical protein  34 
 
 		 518 aa  227  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1481  diguanylate phosphodiesterase  34 
 
 		 518 aa  227  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849847  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02065  hypothetical protein  34 
 
 		 518 aa  227  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1471  hypothetical protein  34 
 
 		 518 aa  227  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000861353  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2314  hypothetical protein  34 
 
 		 518 aa  227  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00271  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.91 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3291  diguanylate phosphodiesterase  41.91 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3314  hypothetical protein  33.78 
 
 		 497 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795943  normal  0.253919 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3308  diguanylate phosphodiesterase  41.91 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00274  hypothetical protein  41.91 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0346  LuxR-family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0333  LuxR-family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0375  LuxR-family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 362 aa  224  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.479547  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0378  LuxR-family transcriptional regulator/cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  42.97 
 
 		 362 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2339  aminoglycoside response regulator  32.44 
 
 		 526 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000320511  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2452  hypothetical protein  31.2 
 
 		 518 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000990794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2364  hypothetical protein  31.2 
 
 		 518 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406164  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2566  hypothetical protein  31.2 
 
 		 518 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233571 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2455  hypothetical protein  31.2 
 
 		 518 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2409  hypothetical protein  31.03 
 
 		 518 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.948391  hitchhiker  0.000104823 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4488  EAL domain protein  28.34 
 
 		 534 aa  216  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4205  EAL domain protein  26.9 
 
 		 535 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2772  hypothetical protein  31 
 
 		 518 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3245  hypothetical protein  31.45 
 
 		 528 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0153368 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2710  hypothetical protein  34.32 
 
 		 526 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2785  hypothetical protein  34.32 
 
 		 526 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0777  EAL domain-containing protein  29.09 
 
 		 519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2811  EAL domain-containing protein  30.13 
 
 		 538 aa  197  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3538  diguanylate phosphodiesterase  28.68 
 
 		 506 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.506628  decreased coverage  0.0000122226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3606  diguanylate phosphodiesterase  28.49 
 
 		 506 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0374  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  37.11 
 
 		 516 aa  197  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0285785 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0705  diguanylate phosphodiesterase  28.49 
 
 		 506 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0383  hypothetical protein  36.77 
 
 		 516 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0298247  normal  0.0200463 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0396  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  36.77 
 
 		 516 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0476649  hitchhiker  0.000376911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0376  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  36.21 
 
 		 516 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000844741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2384  diguanylate phosphodiesterase  29.94 
 
 		 532 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3821  rtn protein  28.32 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3729  diguanylate phosphodiesterase  28.49 
 
 		 506 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2028  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  29.82 
 
 		 533 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0436  cyclic diguanylate phosphodiesterase  36.77 
 
 		 516 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0237258  hitchhiker  0.0000188077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0814  EAL domain-containing protein  29.08 
 
 		 514 aa  189  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1971  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  29.63 
 
 		 533 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1967  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  29.63 
 
 		 533 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.352201  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01785  predicted phosphodiesterase  29.1 
 
 		 532 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1828  diguanylate phosphodiesterase  29.1 
 
 		 532 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.566972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1373  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  29.1 
 
 		 532 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.295034  normal  0.0183228 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1818  diguanylate phosphodiesterase  29.1 
 
 		 532 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0704068  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1268  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  27.03 
 
 		 504 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.585411 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1905  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  29.1 
 
 		 532 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.184783  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0820  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.25 
 
 		 593 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0849  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.25 
 
 		 593 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.386146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0247  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.52 
 
 		 890 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0447  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.02 
 
 		 549 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  35.53 
 
 		 1093 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1304  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  31.14 
 
 		 474 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0784457  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2544  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  28.96 
 
 		 532 aa  186  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0252853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1489  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  30.92 
 
 		 460 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001510  Rtn protein  30.05 
 
 		 490 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1280  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.26 
 
 		 818 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5008  diguanylate phosphodiesterase  27.94 
 
 		 534 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5852  diguanylate phosphodiesterase  27.94 
 
 		 534 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0408  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.68 
 
 		 862 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4327  diguanylate phosphodiesterase  28.23 
 
 		 534 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0532926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3015  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.1 
 
 		 777 aa  178  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.392311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0308  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.44 
 
 		 541 aa  177  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0207  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.98 
 
 		 536 aa  177  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155784  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3579  hypothetical protein  34.57 
 
 		 685 aa  177  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0227937  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1611  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  39.33 
 
 		 946 aa  176  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.319418  normal  0.0964053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1844  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.71 
 
 		 905 aa  176  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000234438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2992  diguanylate phosphodiesterase  28.37 
 
 		 522 aa  176  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2740  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.4 
 
 		 1016 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0568  diguanylate cyclase  36.51 
 
 		 586 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3959  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.92 
 
 		 855 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5670  diguanylate phosphodiesterase  28.6 
 
 		 529 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.981037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0572  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.79 
 
 		 824 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.272236 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5257  diguanylate phosphodiesterase  30.4 
 
 		 588 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0193629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.92 
 
 		 947 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2997  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.97 
 
 		 876 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>