More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1472 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  91.67 
 
 		 408 aa  751    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1414  general secretion pathway protein F  83.29 
 
 		 408 aa  646    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2858  general secretion pathway protein F  83.05 
 
 		 408 aa  659    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1472  general secretion pathway protein F  100 
 
 		 408 aa  815    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0005  general secretion pathway protein F  70.49 
 
 		 407 aa  566  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.138499 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  57.49 
 
 		 406 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  55.64 
 
 		 396 aa  458  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  55.04 
 
 		 405 aa  458  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03958  general secretion pathway protein F  59.17 
 
 		 408 aa  457  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  56.76 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2304  general secretion pathway protein F  55.53 
 
 		 406 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  54.44 
 
 		 413 aa  451  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00603  general secretion pathway protein F  53.07 
 
 		 406 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0233  general secretion pathway protein F  57.42 
 
 		 406 aa  450  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  56.37 
 
 		 407 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0155  general secretion pathway protein F  56.51 
 
 		 407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  56.34 
 
 		 407 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4204  general secretion pathway protein F  56.51 
 
 		 407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0155  general secretion pathway protein F  56.51 
 
 		 407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0107  general secretion pathway protein F  55.75 
 
 		 410 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0151  general secretion pathway protein F  56.51 
 
 		 407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  56.13 
 
 		 407 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  56.93 
 
 		 407 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0153  general secretion pathway protein F  56.37 
 
 		 407 aa  434  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0158  general secretion pathway protein F  56.62 
 
 		 407 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0153  general secretion pathway protein F  56.62 
 
 		 407 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0168  general secretion pathway protein F  57.11 
 
 		 407 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001890  general secretion pathway protein F  53.32 
 
 		 405 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4249  general secretion pathway protein F  54.59 
 
 		 403 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0171  general secretion pathway protein F  55.75 
 
 		 407 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02836  hypothetical type II secretion protein GspF  55.64 
 
 		 407 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000156909  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3410  general secretion pathway protein GspF  55.15 
 
 		 407 aa  415  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02786  hypothetical protein  55.64 
 
 		 407 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3245  general secretion pathway protein GspF  55.64 
 
 		 407 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.750263 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3425  general secretion pathway protein F  55.15 
 
 		 407 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3136  general secretion pathway protein F  55.15 
 
 		 407 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  51.72 
 
 		 403 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2031  general secretion pathway protein F  51.84 
 
 		 405 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24010  general secretion pathway protein F  51.6 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  49.88 
 
 		 404 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03178  general secretory pathway component, cryptic  47.77 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0386  general secretion pathway protein F  47.77 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0386  general secretion pathway protein F  47.77 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3521  general secretion pathway protein F  47.77 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03129  hypothetical protein  47.77 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  47.68 
 
 		 404 aa  363  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0143  general secretion pathway protein F  49.51 
 
 		 407 aa  361  1e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2924  general secretion pathway protein F  50.86 
 
 		 405 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646431  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2371  general secretion pathway protein F  48.05 
 
 		 410 aa  348  9e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1414  general secretion pathway protein F  49.39 
 
 		 405 aa  338  8e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648646  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  43 
 
 		 399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3267  general secretion pathway protein F  42.12 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000000000000079941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0955  general secretion pathway protein F  41.87 
 
 		 400 aa  335  7.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110988  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1006  type II secretion system protein  41.87 
 
 		 400 aa  334  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  42.44 
 
 		 399 aa  333  4e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  44.53 
 
 		 405 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  44.28 
 
 		 405 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  43.49 
 
 		 405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  43.73 
 
 		 405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  43.24 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  43.24 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  43.24 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  43.24 
 
 		 405 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  43 
 
 		 405 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  43 
 
 		 405 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  43 
 
 		 405 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  43 
 
 		 405 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  43 
 
 		 405 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  43 
 
 		 405 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  43 
 
 		 405 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  43 
 
 		 405 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  43 
 
 		 405 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  43.73 
 
 		 405 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3054  general secretion pathway protein F  45.34 
 
 		 403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2209  general secretion pathway protein F  43.35 
 
 		 399 aa  313  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  43.24 
 
 		 405 aa  309  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3401  general secretion pathway protein F  44.61 
 
 		 403 aa  308  9e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.54461 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3116  general secretory pathway F transmembrane protein  44.61 
 
 		 403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1071  general secretion pathway protein F  41.18 
 
 		 405 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  42.36 
 
 		 403 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3231  general secretion pathway protein F  44.09 
 
 		 405 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101612  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4178  general secretion pathway protein F  44.42 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4823  putative type II secretion system protein  44.83 
 
 		 404 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0274243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55430  putative type II secretion system protein  44.58 
 
 		 404 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000716105  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3578  TonB-dependent siderophore receptor  41.99 
 
 		 411 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.477901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1045  general secretion pathway protein F  43.56 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0256  general secretion pathway protein F  45.38 
 
 		 400 aa  286  4e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  40.88 
 
 		 409 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1089  general secretion pathway protein F  44.17 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.419193  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1279  general secretion pathway protein F  41.5 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1071  general secretion pathway protein F  40.44 
 
 		 411 aa  279  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1048  general secretion pathway protein F  43.92 
 
 		 400 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3313  type II secretion system protein  43.67 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5703  general secretion pathway protein F  40.44 
 
 		 408 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0555477  normal  0.0587373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3138  general secretory pathway protein F  40.88 
 
 		 404 aa  271  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000899303 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  36.61 
 
 		 404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1904  general secretion pathway protein F  40.15 
 
 		 401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  37.77 
 
 		 412 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1631  general secretion pathway protein F  41.61 
 
 		 412 aa  270  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2531  general secretion pathway protein F  44.74 
 
 		 410 aa  269  7e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>