More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1451 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  81.97 
 
 		 588 aa  1013    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  81.64 
 
 		 610 aa  1050    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  55.24 
 
 		 609 aa  674    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02747  excinuclease ABC subunit C  62.31 
 
 		 588 aa  769    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003099  excinuclease ABC subunit C  62.82 
 
 		 588 aa  769    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000908036  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  81.8 
 
 		 610 aa  1052    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  56.72 
 
 		 609 aa  707    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1640  excinuclease ABC subunit C  56.39 
 
 		 609 aa  688    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00105988  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3270  excinuclease ABC subunit C  54.82 
 
 		 639 aa  690    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150435  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  81.8 
 
 		 610 aa  1053    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  56.89 
 
 		 609 aa  709    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0834  excinuclease ABC subunit C  62.52 
 
 		 610 aa  797    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000370037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  81.8 
 
 		 610 aa  1051    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2561  excinuclease ABC subunit C  56.89 
 
 		 609 aa  709    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00257936  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  79.34 
 
 		 617 aa  1029    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  81.64 
 
 		 610 aa  1049    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2140  excinuclease ABC subunit C  62.21 
 
 		 608 aa  786    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604529  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  52.62 
 
 		 607 aa  642    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2676  excinuclease ABC subunit C  57.21 
 
 		 609 aa  712    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  56.72 
 
 		 609 aa  719    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  56.93 
 
 		 609 aa  715    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01867  hypothetical protein  80.51 
 
 		 395 aa  663    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000955333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1595  excinuclease ABC subunit C  85.08 
 
 		 610 aa  1098    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  85.25 
 
 		 610 aa  1101    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  55.12 
 
 		 609 aa  686    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  81.64 
 
 		 610 aa  1051    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  79.18 
 
 		 617 aa  1025    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  81.8 
 
 		 610 aa  1052    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  87.54 
 
 		 610 aa  1123    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  81.48 
 
 		 610 aa  1048    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2599  excinuclease ABC subunit C  57.05 
 
 		 609 aa  710    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00115318  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2449  excinuclease ABC subunit C  57.31 
 
 		 608 aa  703    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0823614  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  81.97 
 
 		 610 aa  1054    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  81.8 
 
 		 610 aa  1052    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  79.51 
 
 		 610 aa  1032    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  63.04 
 
 		 609 aa  813    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  81.64 
 
 		 610 aa  1052    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  56.89 
 
 		 609 aa  710    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  56.89 
 
 		 609 aa  709    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2648  excinuclease ABC subunit C  55.74 
 
 		 610 aa  696    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.473447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  81.8 
 
 		 610 aa  1052    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1451  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 610 aa  1259    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  51.48 
 
 		 607 aa  638    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1783  excinuclease ABC subunit C  56.89 
 
 		 610 aa  711    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0533171  hitchhiker  0.000000162173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1825  excinuclease ABC subunit C  56.07 
 
 		 609 aa  698    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.088783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  56.72 
 
 		 609 aa  706    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  80.69 
 
 		 607 aa  1033    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000123696  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  81.64 
 
 		 610 aa  1059    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1608  excinuclease ABC subunit C  59.57 
 
 		 606 aa  739    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00130294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  51.31 
 
 		 607 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  51.15 
 
 		 607 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  51.15 
 
 		 607 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  51.49 
 
 		 609 aa  627  1e-178  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  51.06 
 
 		 608 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02086  excinuclease ABC subunit C  56.76 
 
 		 544 aa  618  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000899057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  50.49 
 
 		 607 aa  621  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  50.74 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  50.66 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  50.66 
 
 		 607 aa  607  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 		 599 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  52.8 
 
 		 619 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  49.42 
 
 		 611 aa  604  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  51.36 
 
 		 585 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  48.6 
 
 		 626 aa  590  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  50.58 
 
 		 607 aa  589  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  50.58 
 
 		 599 aa  589  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  47.94 
 
 		 612 aa  579  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  49.92 
 
 		 604 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  48.85 
 
 		 627 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  47.58 
 
 		 613 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  49.02 
 
 		 621 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1334  excinuclease ABC subunit C  48.76 
 
 		 609 aa  565  1e-160  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000285239  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1803  excinuclease ABC, C subunit  48.78 
 
 		 657 aa  565  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0340936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  48.09 
 
 		 607 aa  565  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1276  excinuclease ABC subunit C  48.26 
 
 		 609 aa  559  1e-158  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00138903  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  47.45 
 
 		 618 aa  552  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  47.22 
 
 		 618 aa  549  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00582  excinuclease ABC subunit C  47.7 
 
 		 618 aa  551  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  46.89 
 
 		 603 aa  544  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1403  excinuclease ABC subunit C  47.53 
 
 		 614 aa  542  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  46.95 
 
 		 613 aa  542  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1271  excinuclease ABC subunit C  47.62 
 
 		 606 aa  534  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2013  excinuclease ABC subunit C  47.27 
 
 		 614 aa  527  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.117598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0205  excinuclease ABC subunit C  47.02 
 
 		 614 aa  526  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0351181  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  47.27 
 
 		 645 aa  526  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  44.44 
 
 		 657 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1001  excinuclease ABC subunit C  44.44 
 
 		 657 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  45.1 
 
 		 605 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  44.33 
 
 		 608 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  44.17 
 
 		 623 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1071  excinuclease ABC subunit C  43.94 
 
 		 654 aa  510  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000538512  normal  0.216036 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  45.68 
 
 		 598 aa  510  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2410  excinuclease ABC subunit C  43.53 
 
 		 673 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308713  hitchhiker  0.000953685 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2244  excinuclease ABC subunit C  44.19 
 
 		 663 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  41.9 
 
 		 674 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  41.27 
 
 		 677 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1019  excinuclease ABC subunit C  40.7 
 
 		 684 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114773  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1101  excinuclease ABC subunit C  41.14 
 
 		 682 aa  485  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1023  excinuclease ABC subunit C  40.56 
 
 		 684 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1143  excinuclease ABC subunit C  41.06 
 
 		 681 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>