More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1388 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01664  predicted acyl-CoA dehydrogenase  91.91 
 
 
383 aa  756    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1947  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  92.17 
 
 
383 aa  759    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0267578  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1898  putative acyl-CoA dehydrogenase  91.91 
 
 
383 aa  756    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1487  putative acyl-CoA dehydrogenase  92.43 
 
 
383 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971669 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1468  putative acyl-CoA dehydrogenase  92.43 
 
 
383 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.283366  normal  0.0792636 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1936  putative acyl-CoA dehydrogenase  92.17 
 
 
383 aa  759    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0137614 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2411  putative acyl-CoA dehydrogenase  92.17 
 
 
383 aa  759    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1816  putative acyl-CoA dehydrogenase  92.43 
 
 
383 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.297013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  92.17 
 
 
383 aa  759    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01653  hypothetical protein  91.91 
 
 
383 aa  756    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1987  putative acyl-CoA dehydrogenase  92.17 
 
 
383 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143395  hitchhiker  0.00158428 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1452  putative acyl-CoA dehydrogenase  92.43 
 
 
383 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.215854  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1501  putative acyl-CoA dehydrogenase  92.17 
 
 
384 aa  759    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1911  putative acyl-CoA dehydrogenase  92.17 
 
 
383 aa  759    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1388  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
383 aa  804    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.977333  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1403  putative acyl-CoA dehydrogenase  66.4 
 
 
381 aa  555  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4600  putative acyl-CoA dehydrogenase  57.42 
 
 
380 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1021  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.74 
 
 
383 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2878  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.51 
 
 
391 aa  406  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0570  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  48.56 
 
 
377 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.741044  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0080  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.38 
 
 
380 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.38 
 
 
380 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214032  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0079  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.38 
 
 
380 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0999313  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0081  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.38 
 
 
380 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124381  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.38 
 
 
380 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00043  crotonobetaine reductase subunit II, FAD-binding  47.12 
 
 
380 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3560  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.12 
 
 
380 aa  363  4e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.12 
 
 
380 aa  363  4e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00042  hypothetical protein  47.12 
 
 
380 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0040  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.12 
 
 
380 aa  363  4e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0041  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.12 
 
 
380 aa  363  4e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3616  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.12 
 
 
380 aa  363  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0669979 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.12 
 
 
380 aa  363  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3228  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  44.88 
 
 
378 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4037  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  45.41 
 
 
378 aa  345  6e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2675  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  44.62 
 
 
378 aa  340  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09220  acyl-CoA dehydrogenase  44.16 
 
 
385 aa  334  1e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605884  normal  0.299074 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1834  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  42.38 
 
 
383 aa  312  6.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08800  acyl-CoA dehydrogenase  43.08 
 
 
384 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.320154 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1840  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.71 
 
 
384 aa  303  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0618853  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0310  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.46 
 
 
383 aa  294  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.48 
 
 
385 aa  290  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.509328  hitchhiker  0.00141201 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1861  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.27 
 
 
394 aa  264  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.128157  normal  0.323931 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1436  butyryl-CoA dehydrogenase  34.44 
 
 
410 aa  208  1e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.170652  hitchhiker  0.00553945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1590  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.16 
 
 
396 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.29 
 
 
383 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.67 
 
 
379 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 
392 aa  202  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4210  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.46 
 
 
399 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0538412  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.16 
 
 
376 aa  202  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0456  butyryl-CoA dehydrogenase  33.16 
 
 
410 aa  202  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.820933  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2429  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.52 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2442  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.95 
 
 
395 aa  200  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.830058  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  32.9 
 
 
381 aa  199  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  32.9 
 
 
376 aa  199  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  32.9 
 
 
376 aa  199  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  32.9 
 
 
376 aa  199  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  32.9 
 
 
381 aa  199  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  32.9 
 
 
381 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  32.9 
 
 
376 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.99 
 
 
388 aa  199  7.999999999999999e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.37 
 
 
380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  32.64 
 
 
376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.25 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5206  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  32.71 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  32.64 
 
 
376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0668  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.09 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.64 
 
 
376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.33 
 
 
379 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1147  acyl-CoA dehydrogenase  32.35 
 
 
390 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2771  acyl-CoA dehydrogenase  32.35 
 
 
390 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2926  acyl-CoA dehydrogenase  32.35 
 
 
390 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.532316  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0838  butyryl-CoA dehydrogenase  33.16 
 
 
410 aa  196  6e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09270  acyl-CoA dehydrogenase  34.04 
 
 
388 aa  196  7e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.36 
 
 
385 aa  196  8.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.37 
 
 
380 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.12 
 
 
380 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3267  Acyl-CoA dehydrogenase-like  33.05 
 
 
379 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.691288  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2198  acyl-CoA dehydrogenase-like  32.77 
 
 
379 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.583783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3756  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.69 
 
 
404 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3744  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  31.69 
 
 
404 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3817  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.69 
 
 
404 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.420794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.98 
 
 
400 aa  192  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.02 
 
 
381 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1608  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.01 
 
 
388 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0385936  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.94 
 
 
389 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.67 
 
 
398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0292  acyl-CoA dehydrogenase  31.65 
 
 
390 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.83 
 
 
394 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.99 
 
 
380 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0488  butyryl-CoA dehydrogenase  33.25 
 
 
379 aa  190  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00678793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.51 
 
 
375 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0934  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.02 
 
 
387 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.496704 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  31.76 
 
 
381 aa  189  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  31.76 
 
 
381 aa  189  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  31.76 
 
 
381 aa  189  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  31.76 
 
 
381 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0234  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.71 
 
 
386 aa  189  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  31.76 
 
 
381 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3683  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.23 
 
 
384 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>