More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1312 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  100 
 
 
262 aa  518  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2690  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  90.04 
 
 
273 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0891  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  82.87 
 
 
254 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0517  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  82.03 
 
 
262 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4027  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  84.06 
 
 
263 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3698  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  84.06 
 
 
263 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4338  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  84.15 
 
 
252 aa  417  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4563  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  84.15 
 
 
252 aa  417  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3564  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  84.06 
 
 
262 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4651  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  84.15 
 
 
252 aa  417  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5610  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  83.74 
 
 
252 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03969  carbon-phosphorus lyase complex subunit  84.15 
 
 
252 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3894  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  84.15 
 
 
252 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  84.15 
 
 
252 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03929  hypothetical protein  84.15 
 
 
252 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0301  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  83.33 
 
 
251 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0483  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  73.62 
 
 
262 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0579  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  73.23 
 
 
262 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2882  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  71.31 
 
 
269 aa  344  7e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769928  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3332  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.75 
 
 
284 aa  344  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2192  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.8 
 
 
258 aa  341  5e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0274  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.19 
 
 
258 aa  339  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0762  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.97 
 
 
258 aa  338  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000264723  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4778  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.09 
 
 
260 aa  337  9e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  0.35491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20400  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.06 
 
 
271 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110651  normal  0.49891 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4434  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.8 
 
 
258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4231  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.92 
 
 
258 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.503556  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1753  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.06 
 
 
271 aa  335  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4120  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.02 
 
 
258 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2563  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  69.72 
 
 
273 aa  332  5e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2255  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  70.12 
 
 
273 aa  332  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000530025  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3829  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.78 
 
 
266 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.179517  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5844  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.2 
 
 
264 aa  325  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71167  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4093  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.39 
 
 
266 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0758  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.34 
 
 
272 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850324  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2961  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.96 
 
 
257 aa  322  4e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919043  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0817  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.75 
 
 
257 aa  321  6e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2919  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.12 
 
 
262 aa  321  9.000000000000001e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0502891  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.33 
 
 
256 aa  319  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2910  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.35 
 
 
257 aa  318  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.838485  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6094  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.54 
 
 
263 aa  315  6e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.71 
 
 
265 aa  313  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4190  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.58 
 
 
258 aa  311  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3852  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.22 
 
 
257 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4211  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.68 
 
 
256 aa  310  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.46 
 
 
262 aa  307  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3307  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.61 
 
 
256 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761331  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1181  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.61 
 
 
256 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3341  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.61 
 
 
256 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2590  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.61 
 
 
256 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0141  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.31 
 
 
294 aa  298  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2404  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.22 
 
 
256 aa  298  6e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0320  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.22 
 
 
256 aa  298  6e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3353  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  65.49 
 
 
611 aa  298  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403888  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2183  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.01 
 
 
256 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481502  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5944  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.01 
 
 
256 aa  297  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2915  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.35 
 
 
254 aa  295  6e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3777  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.22 
 
 
256 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  59.76 
 
 
260 aa  288  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  59.76 
 
 
260 aa  288  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0428  ABC type ATPase  54.7 
 
 
283 aa  238  8e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.602427  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0464  ABC type ATPase  54.7 
 
 
283 aa  238  8e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.849392  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5001  ABC transporter related  51.52 
 
 
276 aa  235  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.20285  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2292  ABC phosphonate transport system ATPase  46.18 
 
 
276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4041  ABC transporter related  47.89 
 
 
276 aa  230  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0221  ABC transporter related  47.89 
 
 
276 aa  230  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3788  ABC transporter related  50.22 
 
 
276 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3839  ABC transporter related  50.22 
 
 
276 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.588878  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3688  ABC transporter for phosphonate ATP-binding protein  48.48 
 
 
278 aa  225  5.0000000000000005e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2086  ABC transporter related  48.48 
 
 
278 aa  223  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4145  ABC transporter related  50.22 
 
 
276 aa  218  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2293  ABC transporter related  49.78 
 
 
276 aa  217  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3508  ABC transporter related  48.92 
 
 
279 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1587  ABC transporter related  48.28 
 
 
280 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0232  ABC transporter related  46.55 
 
 
286 aa  205  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5869  ABC transporter-related protein  49.78 
 
 
291 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  41.98 
 
 
593 aa  186  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  43.81 
 
 
619 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.82 
 
 
326 aa  178  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  40.69 
 
 
629 aa  177  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0747  hypothetical protein  37.59 
 
 
602 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0025  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.33 
 
 
347 aa  176  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.408235  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  41.86 
 
 
593 aa  175  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0728  hypothetical protein  38.35 
 
 
603 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  40.95 
 
 
612 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12490  Oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding component  42.47 
 
 
322 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1777  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000396246 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.24 
 
 
338 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.861389  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2963  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.13 
 
 
338 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0111  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.98 
 
 
322 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  42.86 
 
 
603 aa  172  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4179  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.41 
 
 
364 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  43.46 
 
 
601 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  41.6 
 
 
613 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0817  ABC transporter related  43.36 
 
 
285 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5440  ABC transporter related  41.54 
 
 
285 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574326  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3799  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.62 
 
 
364 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0982  ABC transporter related protein  38.02 
 
 
564 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.073817  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  39.22 
 
 
611 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0193  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.02 
 
 
343 aa  170  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>