More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1279 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1279  hydrogenase 4 subunit H  100 
 
 
189 aa  397  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641192  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2714  hydrogenase 4 subunit H  80.21 
 
 
189 aa  325  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.594807  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2429  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  56.18 
 
 
181 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839749  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2860  hydrogenase 4 subunit H  58.93 
 
 
179 aa  206  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3158  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  52.81 
 
 
180 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.088865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3000  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  52.25 
 
 
180 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397657  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3971  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  52.25 
 
 
180 aa  201  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02570  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur protein  52.25 
 
 
180 aa  201  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3008  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  52.25 
 
 
180 aa  201  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0992  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  52.25 
 
 
180 aa  201  7e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2185  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  56.1 
 
 
184 aa  201  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2856  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  52.25 
 
 
180 aa  201  7e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02535  hypothetical protein  52.25 
 
 
180 aa  201  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4569  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  53.71 
 
 
189 aa  200  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2969  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  52.25 
 
 
180 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2845  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  51.69 
 
 
180 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.105843 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3035  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  52.25 
 
 
180 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3156  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  52.25 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3051  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  52.25 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.266242 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0969  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.69 
 
 
180 aa  198  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3193  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  52.25 
 
 
180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02380  hydrogenase 4, Fe-S subunit  56.55 
 
 
179 aa  195  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1188  hydrogenase 4 subunit H  56.55 
 
 
179 aa  195  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40586 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02342  hypothetical protein  56.55 
 
 
179 aa  195  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2622  hydrogenase 4 subunit H  56.55 
 
 
179 aa  195  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3710  hydrogenase 4 subunit H  57.74 
 
 
181 aa  187  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2635  hydrogenase 4 subunit H  58.33 
 
 
181 aa  179  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2770  hydrogenase 4 subunit H  58.33 
 
 
181 aa  179  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  55.75 
 
 
181 aa  176  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1867  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.79 
 
 
179 aa  155  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0712  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  41.07 
 
 
179 aa  147  9e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00445731  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1636  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  41.57 
 
 
179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0109811  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01000  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  49.38 
 
 
181 aa  143  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.598496  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.07 
 
 
194 aa  137  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0126  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  40.74 
 
 
176 aa  125  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0318  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.91 
 
 
175 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2784  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.77 
 
 
175 aa  98.6  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2792  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.77 
 
 
175 aa  98.6  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2225  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.46 
 
 
119 aa  88.6  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0702  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.06 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3251  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.25 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.32 
 
 
153 aa  77.4  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00573386  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3660  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  37.04 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3786  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  36.04 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.312558 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3718  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  37.04 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0184008  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1921  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.32 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1128  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.87 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.45 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3746  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.38 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.25 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  40.74 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.04 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1302  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.31 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4503  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.17 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.89 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1619  ech hydrogenase subunit F  38.46 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  43.59 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1083  NADH dehydrogenase subunit I  36.11 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1899  NADH dehydrogenase subunit I  34.31 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00550248  normal  0.26939 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.68 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0369  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  36.84 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.639701  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  35.29 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  35.29 
 
 
211 aa  72  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0966  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.82 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.37 
 
 
168 aa  72  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.45 
 
 
229 aa  72  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.662861 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  31.2 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  31.2 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0341  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  36.61 
 
 
252 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925299  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1556  NADH dehydrogenase subunit I  32.52 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000101443  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1742  NADH dehydrogenase subunit I  32.52 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  31.2 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5420  NADH dehydrogenase subunit I  33.05 
 
 
139 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5145  NADH dehydrogenase subunit I  33.05 
 
 
139 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4977  NADH dehydrogenase subunit I  33.05 
 
 
139 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4995  NADH dehydrogenase subunit I  33.05 
 
 
139 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5471  NADH dehydrogenase subunit I  33.05 
 
 
139 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  31.2 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2631  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.87866  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  32.03 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5537  NADH dehydrogenase subunit I  33.05 
 
 
139 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  31.2 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5534  NADH dehydrogenase subunit I  33.05 
 
 
139 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0249659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  31.2 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5416  NADH dehydrogenase subunit I  33.05 
 
 
139 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  33.05 
 
 
139 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  28.95 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1922  NADH dehydrogenase subunit I  32.52 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000283263  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0677  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.11 
 
 
148 aa  70.9  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5093  NADH dehydrogenase subunit I  33.05 
 
 
139 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  32 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  34.19 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  32 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5386  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1901e-17 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  31.2 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1578  NADH dehydrogenase subunit I  30.4 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116678  normal  0.902926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  33.88 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>