More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1271 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1271  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 227 aa  461  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2524  transcriptional regulator, GntR family  66.67 
 
 		 226 aa  293  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2179  transcriptional regulator, GntR family  65.75 
 
 		 221 aa  291  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1096  transcriptional regulator, putative  38.76 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1703  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1074  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 243 aa  141  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.605051  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0010  GntR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  hitchhiker  0.00449189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5666  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 234 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0339  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4655  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 244 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4128  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  0.239591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4254  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  35.16 
 
 		 226 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3745  transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0431  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0389  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6220  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 266 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3699  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4698  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 217 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1190  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.814536  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1556  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3971  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 248 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1255  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0504  transcriptional regulator, GntR family  39.9 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0329427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2357  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2101  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.98754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2281  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.487352  normal  0.0140544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1572  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.84 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.247698  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1767  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.84 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1703  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.84 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1753  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.84 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1706  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.84 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.160126  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2183  transcriptional regulator GntR  34.41 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.484217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4646  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.221886 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6054  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3677  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0860  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0607  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0421705  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2417  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4021  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2196  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148573  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1631  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.31 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1536  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.47 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1038  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2056  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.63 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144632 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2339  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  98.6  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0838  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 217 aa  98.6  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0913555 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01407  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.96 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1124  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01418  hypothetical protein  30.96 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1721  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.14 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356206 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2209  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.96 
 
 		 221 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0776  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3751  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4225  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3188  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 236 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2985  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1984  putative HTH-type transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4031  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 236 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4335  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 236 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3900  hypothetical protein  32.16 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365064 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6417  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4275  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3956  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374286  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2985  HTH-type transcriptional regulator  31.19 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5547  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 246 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5912  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 246 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0093  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 216 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0981  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0509  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.137799 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2641  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  30.92 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3573  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 237 aa  85.5  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  36.46 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  31.87 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2902  GntR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3609  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  24.46 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0470  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0205  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134484 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>