More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1248 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  100 
 
 
282 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  62.14 
 
 
283 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.04 
 
 
273 aa  315  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  52.52 
 
 
285 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.85 
 
 
272 aa  266  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 
268 aa  265  5.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.12 
 
 
274 aa  259  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.89 
 
 
272 aa  258  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  47.81 
 
 
274 aa  258  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
275 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  50 
 
 
274 aa  255  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  49.64 
 
 
274 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  49.64 
 
 
274 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.35 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.72 
 
 
273 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  42.28 
 
 
287 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  44.69 
 
 
303 aa  236  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.45 
 
 
292 aa  225  7e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  45.35 
 
 
280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  45.1 
 
 
280 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
278 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
281 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
282 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
282 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.45 
 
 
282 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.6 
 
 
279 aa  205  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 
277 aa  205  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6368  short chain dehydrogenase  42.44 
 
 
279 aa  205  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  39.71 
 
 
284 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.6 
 
 
276 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.16 
 
 
280 aa  199  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 
289 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  39.34 
 
 
284 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
293 aa  198  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  40 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
287 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
282 aa  195  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2331  short chain dehydrogenase  45.59 
 
 
285 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
288 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 
285 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.45 
 
 
282 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
290 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
286 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 
280 aa  193  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.37 
 
 
283 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 
276 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  41.54 
 
 
279 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 
276 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  38.87 
 
 
284 aa  190  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 
278 aa  189  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.41 
 
 
279 aa  189  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  38.81 
 
 
284 aa  188  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
279 aa  188  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
280 aa  188  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 
276 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 
274 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
279 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 
285 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
283 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.406068  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
281 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 
291 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 
291 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 
291 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
287 aa  185  6e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.94 
 
 
280 aa  185  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12080  short-chain alcohol dehydrogenase  40.91 
 
 
266 aa  183  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 
291 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.1 
 
 
293 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 
284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 
282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
276 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  37.22 
 
 
276 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.37 
 
 
279 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.7 
 
 
275 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
291 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.85 
 
 
283 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 
276 aa  181  9.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 
282 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  37.41 
 
 
344 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
305 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0930  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
279 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.64 
 
 
281 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
290 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  38.43 
 
 
278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  35.85 
 
 
282 aa  179  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
276 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.83 
 
 
280 aa  179  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 
273 aa  178  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
280 aa  178  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
296 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
284 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1744  short chain dehydrogenase  38.81 
 
 
275 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324234  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 
286 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8863  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  0.72851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>