More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1244 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1244  malonate decarboxylase subunit beta  100 
 
 
277 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3776  malonate decarboxylase subunit beta  87.73 
 
 
277 aa  455  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2609  malonate decarboxylase subunit beta  84.84 
 
 
277 aa  433  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.17179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5084  malonate decarboxylase, beta subunit  68.98 
 
 
283 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0445  malonate decarboxylase subunit beta  69.34 
 
 
283 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10310  malonate decarboxylase subunit beta  68.48 
 
 
283 aa  371  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00325574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0949  malonate decarboxylase subunit beta  64.71 
 
 
292 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336349  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02580  malonate decarboxylase subunit beta  69.26 
 
 
287 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0046071  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0295  malonate decarboxylase subunit beta  67.78 
 
 
287 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.354415  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3866  malonate decarboxylase subunit beta  66.04 
 
 
281 aa  354  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4942  malonate decarboxylase subunit beta  66.04 
 
 
281 aa  354  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0873068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5299  malonate decarboxylase subunit beta  68 
 
 
283 aa  345  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2441  malonate decarboxylase subunit beta  66.42 
 
 
282 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139783  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2880  malonate decarboxylase subunit beta  64.13 
 
 
282 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4928  malonate decarboxylase subunit beta  65.54 
 
 
286 aa  333  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5084  malonate decarboxylase subunit beta  64.03 
 
 
296 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297024  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3657  Acetyl-CoA carboxylase beta subunit-like protein  60.07 
 
 
380 aa  323  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1847  malonate decarboxylase subunit beta  63.64 
 
 
300 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5038  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4818  malonate decarboxylase subunit beta  62.45 
 
 
294 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049139  normal  0.0262322 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4590  malonate decarboxylase subunit beta  56.2 
 
 
290 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4018  malonate decarboxylase subunit beta  39.39 
 
 
300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0792  beta subunit of malonate decarboxylase  40.23 
 
 
311 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0446247  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1845  malonate decarboxylase subunit beta  38.06 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5372  malonate decarboxylase subunit beta  42.47 
 
 
292 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1059  malonate decarboxylase subunit beta  43.04 
 
 
318 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246574  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1144  malonate decarboxylase subunit beta  40.26 
 
 
295 aa  172  5e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.431032  normal  0.55922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3296  malonate decarboxylase subunit beta  43.22 
 
 
318 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0077  malonate decarboxylase subunit beta  42.11 
 
 
300 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.405933 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1079  malonate decarboxylase subunit beta  43.11 
 
 
302 aa  169  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1766  malonate decarboxylase subunit beta  39.84 
 
 
305 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38997  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2893  malonate decarboxylase subunit beta  41.55 
 
 
291 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1324  malonate decarboxylase subunit beta  41.28 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2894  acetyl-CoA carboxylase beta subunit  37.25 
 
 
297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25289  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1161  malonate decarboxylase subunit beta  43.42 
 
 
307 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0790  malonate decarboxylase subunit beta  41.86 
 
 
309 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1271  malonate decarboxylase subunit beta  41.86 
 
 
309 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00826271  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1243  malonate decarboxylase subunit beta  41.47 
 
 
311 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  0.0801604 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1149  malonate decarboxylase subunit beta  44.09 
 
 
311 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571735  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0169  malonate decarboxylase subunit beta  40.53 
 
 
309 aa  155  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0048  malonate decarboxylase subunit beta  40.47 
 
 
310 aa  155  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179733  normal  0.0754943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4414  malonate decarboxylase subunit beta  43.36 
 
 
334 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.671916  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3153  malonate decarboxylase subunit beta  40.38 
 
 
306 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2048  malonate decarboxylase subunit beta  44.55 
 
 
310 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4288  malonate decarboxylase subunit beta  43.1 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49827  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0026  malonate decarboxylase subunit beta  41.25 
 
 
310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.840906  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6855  malonate decarboxylase subunit beta  42.06 
 
 
306 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0027  malonate decarboxylase subunit beta  40.86 
 
 
310 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3190  malonate decarboxylase subunit beta  38.46 
 
 
309 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409108 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3035  malonate decarboxylase subunit beta  42.24 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1584  malonate decarboxylase subunit beta  42.24 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1454  malonate decarboxylase subunit beta  42.24 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601121  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0541  malonate decarboxylase subunit beta  42.24 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0612  malonate decarboxylase subunit beta  42.24 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241216  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1484  malonate decarboxylase subunit beta  42.24 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1258  malonate decarboxylase subunit beta  42.24 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2801  malonate decarboxylase subunit beta  42.24 
 
 
315 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546817  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2494  malonate decarboxylase subunit beta  33.48 
 
 
398 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  32.03 
 
 
499 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2554  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.17 
 
 
304 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2508  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.17 
 
 
304 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2608  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.17 
 
 
304 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0772282 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2596  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.17 
 
 
304 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2717  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.17 
 
 
304 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.339712  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02241  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.17 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  34.17 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.334325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02201  hypothetical protein  34.17 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2694  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.17 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1336  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.17 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.862473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2472  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.17 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2610  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.17 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3456  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.17 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2467  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.17 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  35.36 
 
 
541 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2865  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  33.17 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3332  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  35.08 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176388  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1370  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  36.13 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  33.88 
 
 
522 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1422  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.55 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  36.02 
 
 
517 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0359  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.55 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1467  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  39.86 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1531  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.55 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  31.67 
 
 
510 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2798  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  39.16 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.408856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  33.15 
 
 
530 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  33.71 
 
 
527 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  33.7 
 
 
534 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1796  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  33.33 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2574  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  38.41 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33750  acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  34.92 
 
 
559 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  33.52 
 
 
516 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  33.52 
 
 
516 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  32.6 
 
 
536 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  32.04 
 
 
517 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  33.71 
 
 
527 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0437  carboxyl transferase  32.02 
 
 
509 aa  73.9  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.137321  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  33.71 
 
 
529 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  32.58 
 
 
522 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  32.02 
 
 
510 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  32.02 
 
 
510 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>