83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1199 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  54.24 
 
 
611 aa  679    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  54.58 
 
 
611 aa  685    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  62.04 
 
 
604 aa  741    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  100 
 
 
599 aa  1201    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  50.5 
 
 
618 aa  604  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  50.5 
 
 
618 aa  604  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  50.5 
 
 
618 aa  604  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  46.43 
 
 
611 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  43.16 
 
 
617 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  43 
 
 
617 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  43.16 
 
 
617 aa  513  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  43.16 
 
 
617 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  43.16 
 
 
617 aa  513  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  43 
 
 
617 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  43.33 
 
 
617 aa  515  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  43 
 
 
617 aa  511  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  43 
 
 
617 aa  511  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  43.42 
 
 
618 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  43.09 
 
 
618 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  43.09 
 
 
618 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  43.09 
 
 
618 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  43.09 
 
 
618 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  42.83 
 
 
615 aa  494  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  21.72 
 
 
695 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  21.43 
 
 
695 aa  123  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  22.32 
 
 
606 aa  114  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  21.04 
 
 
703 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  22.56 
 
 
606 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  22.89 
 
 
614 aa  105  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  22.39 
 
 
606 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  21.96 
 
 
606 aa  103  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  22.3 
 
 
606 aa  103  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  21.59 
 
 
614 aa  103  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  22.79 
 
 
607 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  21.51 
 
 
611 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  23.79 
 
 
604 aa  98.6  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  23.97 
 
 
612 aa  97.4  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  22.13 
 
 
607 aa  95.5  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  22.13 
 
 
607 aa  94  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  22.96 
 
 
607 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  22.14 
 
 
696 aa  90.1  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  21.67 
 
 
608 aa  87.8  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  22.59 
 
 
649 aa  80.5  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  19.26 
 
 
606 aa  79  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  22.14 
 
 
640 aa  70.9  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  19.34 
 
 
640 aa  69.7  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  24.31 
 
 
797 aa  68.6  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  34.07 
 
 
719 aa  66.2  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  21.66 
 
 
709 aa  65.1  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  22.17 
 
 
732 aa  64.3  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  34.96 
 
 
675 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  23.4 
 
 
506 aa  61.2  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  40 
 
 
812 aa  60.1  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  20.8 
 
 
742 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  32.5 
 
 
699 aa  57.4  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  22.44 
 
 
712 aa  57  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  23.61 
 
 
701 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  24.71 
 
 
1077 aa  55.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  26.98 
 
 
502 aa  55.5  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  26.98 
 
 
508 aa  55.5  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  19.92 
 
 
655 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  22.22 
 
 
725 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  28.03 
 
 
660 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  28.89 
 
 
660 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  21.4 
 
 
704 aa  52  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  22.02 
 
 
609 aa  51.2  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  29.46 
 
 
740 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  26.67 
 
 
748 aa  49.3  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  27.78 
 
 
893 aa  48.9  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  21.61 
 
 
741 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  21.84 
 
 
682 aa  47.8  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  24.24 
 
 
789 aa  47.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  24.53 
 
 
745 aa  47  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  22.34 
 
 
748 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  22.04 
 
 
1238 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  26.85 
 
 
711 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  22.6 
 
 
748 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  23.2 
 
 
826 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  24.19 
 
 
656 aa  45.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  28.46 
 
 
656 aa  45.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  20.24 
 
 
677 aa  45.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  21.83 
 
 
748 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  20.73 
 
 
1234 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>