75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1124 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
142 aa  263  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  87.32 
 
 
142 aa  236  6.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  85.92 
 
 
142 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  90.85 
 
 
142 aa  206  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  80.28 
 
 
142 aa  203  8e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  80.28 
 
 
142 aa  203  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  79.58 
 
 
142 aa  201  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.63 
 
 
143 aa  181  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  64.54 
 
 
142 aa  169  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  64.54 
 
 
142 aa  169  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  64.54 
 
 
142 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  64.54 
 
 
142 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  64.54 
 
 
142 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  64.54 
 
 
142 aa  169  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  64.54 
 
 
142 aa  169  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  64.54 
 
 
142 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  62.41 
 
 
142 aa  166  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  62.41 
 
 
142 aa  166  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  60.28 
 
 
142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.27 
 
 
137 aa  111  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  44.68 
 
 
146 aa  110  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.1 
 
 
137 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.44 
 
 
138 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 
143 aa  107  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  43.48 
 
 
143 aa  107  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.14 
 
 
141 aa  104  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  40.43 
 
 
137 aa  104  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  42.86 
 
 
139 aa  103  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  40.71 
 
 
144 aa  103  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  41.84 
 
 
141 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  41.84 
 
 
142 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.2 
 
 
153 aa  102  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  40.71 
 
 
145 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  41.43 
 
 
145 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  41.84 
 
 
142 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  40 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.29 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  47.14 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  42.54 
 
 
145 aa  99  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.68 
 
 
144 aa  97.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  44.68 
 
 
146 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  37.41 
 
 
293 aa  96.3  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.41 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  39.86 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  45.77 
 
 
145 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.8 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.29 
 
 
145 aa  94.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  44.6 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.38 
 
 
137 aa  93.6  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.81 
 
 
146 aa  93.6  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.32 
 
 
145 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 
145 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.13 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  45.8 
 
 
145 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  39.13 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.85 
 
 
287 aa  88.2  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  40.58 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  40.58 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  40.58 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  43.97 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  43.75 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  43.97 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  38.4 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.41 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.97 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3977  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.04 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000701151  hitchhiker  0.00000000199518 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1359  hypothetical protein  29.2 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08310  membrane protein  37.07 
 
 
360 aa  46.2  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.229987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3024  hypothetical protein  39.19 
 
 
298 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  19.01 
 
 
291 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  32.18 
 
 
303 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  31.03 
 
 
285 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  31.03 
 
 
285 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  31.03 
 
 
285 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>