More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0943 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 242 aa  502  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  84.68 
 
 		 239 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  32.89 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 252 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  36.16 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  28.31 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  35.03 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  30.14 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  32.97 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  31.07 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  33.53 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.94 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  27.52 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 218 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  32.78 
 
 		 256 aa  101  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  31.32 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  30.8 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  32.72 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  32.93 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  31.89 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  32.93 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  32.93 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  29.74 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  29.33 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  29.78 
 
 		 250 aa  99.4  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  29.2 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  29.03 
 
 		 228 aa  99.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 253 aa  99  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  26.79 
 
 		 230 aa  98.2  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  32.09 
 
 		 269 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  29.03 
 
 		 228 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  32.34 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  26.91 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  30.81 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  32.34 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  29.55 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  31.73 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  29.31 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  30.14 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  30 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  30.49 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  28.93 
 
 		 215 aa  95.9  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  29.2 
 
 		 229 aa  95.5  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  30.14 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  35.06 
 
 		 260 aa  95.1  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  34.55 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  33.91 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  28.95 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  28.44 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  25.45 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  28.25 
 
 		 223 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.86 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  28.95 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  28.95 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  28.95 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  29.33 
 
 		 251 aa  92.8  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  28.73 
 
 		 245 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  30.23 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  34.55 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4809  transcriptional regulator PdhR  31.64 
 
 		 263 aa  92.4  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.28 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  26.91 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  27.52 
 
 		 252 aa  92  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 255 aa  91.7  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  28.32 
 
 		 250 aa  91.7  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  27.24 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  31.21 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  27.69 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  26.94 
 
 		 226 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  28.44 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  28.07 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  32.9 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>