232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0893 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0893  AzlC family protein  100 
 
 
250 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  76.29 
 
 
237 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  77.82 
 
 
246 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  81.08 
 
 
243 aa  341  5.999999999999999e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3456  putative azaleucine resistance protein AzlC  75.23 
 
 
257 aa  341  8e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3335  AzlC family protein  75.23 
 
 
257 aa  341  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3198  putative azaleucine resistance protein AzlC  74.77 
 
 
257 aa  339  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3739  AzlC family protein  66.67 
 
 
248 aa  332  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.301924 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2965  branched chain amino acid ABC transporter  69.78 
 
 
245 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02537  predicted transporter  69.33 
 
 
245 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1002  AzlC family protein  69.33 
 
 
245 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02502  hypothetical protein  69.33 
 
 
245 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1025  AzlC family protein  69.33 
 
 
245 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0836238 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2818  branched chain amino acid ABC transporter  69.33 
 
 
245 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3194  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  70.27 
 
 
245 aa  319  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3926  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  70.18 
 
 
230 aa  315  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.645111 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2804  branched chain amino acid ABC transporter  70.18 
 
 
230 aa  315  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.1492  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03312  putative amino acid transporter  38.8 
 
 
240 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  40 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0390  AzlC-like protein  38.59 
 
 
242 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.709784  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  32.74 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4228  hypothetical protein  36.87 
 
 
226 aa  101  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.988743 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  29.35 
 
 
239 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  32.28 
 
 
238 aa  99.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1853  AzlC family protein  36.79 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  34.22 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  31.75 
 
 
238 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  37.02 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  32.2 
 
 
229 aa  95.9  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  32.63 
 
 
238 aa  95.5  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  32.99 
 
 
282 aa  95.5  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  31.61 
 
 
238 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  31.12 
 
 
240 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1280  branched chain amino acid efflux pump, LivE family, large subunit  36.11 
 
 
243 aa  94  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.228947  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  32.43 
 
 
233 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2597  AzlC family protein  31.58 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  32.98 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  34.44 
 
 
241 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  34.44 
 
 
241 aa  92.4  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  34.44 
 
 
241 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  32.32 
 
 
244 aa  92.4  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  34.44 
 
 
241 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1426  AzlC-like protein  30.58 
 
 
244 aa  92.4  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000261082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  34.44 
 
 
241 aa  92  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  32.82 
 
 
240 aa  92  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  33.89 
 
 
241 aa  92  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  34.44 
 
 
241 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  32.83 
 
 
242 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  31.98 
 
 
257 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  30.13 
 
 
273 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  33.33 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  31.88 
 
 
273 aa  89  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  30.88 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  31.37 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  30.88 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  33.33 
 
 
238 aa  87  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  29.41 
 
 
293 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  33.51 
 
 
307 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  32.97 
 
 
238 aa  86.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1105  AzlC-like  34.41 
 
 
243 aa  85.5  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.316521  normal  0.217152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  32.16 
 
 
243 aa  85.5  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  32.2 
 
 
265 aa  85.1  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  29.63 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3065  AzlC family protein  34.34 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  32.63 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  29.53 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  28.14 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2543  AzlC family protein  32.97 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1543  AzlC family protein  32.72 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  29.13 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  28.4 
 
 
246 aa  82  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  28.21 
 
 
242 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3724  AzlC family protein  30.84 
 
 
235 aa  82  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  31.19 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  28.51 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  31 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  30.6 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  31.28 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  29.69 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  32.72 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  32.72 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  31.11 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  29.15 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1542  AzlC family protein  30.23 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.587994  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  31.21 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  31.58 
 
 
247 aa  78.6  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  29.33 
 
 
236 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  32.32 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  26.91 
 
 
234 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  33.04 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  29.08 
 
 
242 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  31.22 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  33.99 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  31.56 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  29.59 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  32.75 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0298  AzlC-like  32.24 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  28.35 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  31.41 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2349  AzlC family protein  29.11 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>