More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0859 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02608  sulfite reductase, beta subunit, NAD(P)-binding, heme-binding  80.56 
 
 
570 aa  992    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0925  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein, beta-component  80.56 
 
 
570 aa  991    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.294862  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2891  sulfite reductase subunit beta  80.74 
 
 
570 aa  993    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0859  sulfite reductase subunit beta  100 
 
 
571 aa  1180    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.753141  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3112  sulfite reductase subunit beta  80.74 
 
 
570 aa  993    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3101  sulfite reductase subunit beta  80.21 
 
 
570 aa  984    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159478  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4760  sulfite reductase subunit beta  69.3 
 
 
584 aa  835    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3737  sulfite reductase subunit beta  59.07 
 
 
565 aa  706    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3077  sulfite reductase subunit beta  80.04 
 
 
570 aa  981    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.900908  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3158  sulfite reductase subunit beta  80.39 
 
 
570 aa  988    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.790155  normal  0.367122 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3259  sulfite reductase subunit beta  80.39 
 
 
570 aa  986    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.301229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0654  sulfite reductase subunit beta  57.3 
 
 
565 aa  686    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3142  sulfite reductase subunit beta  80.04 
 
 
570 aa  981    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.719922  normal  0.480652 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3065  sulfite reductase subunit beta  80.74 
 
 
570 aa  993    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0954  sulfite reductase subunit beta  58.19 
 
 
565 aa  701    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3806  sulfite reductase subunit beta  57.98 
 
 
587 aa  696    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0763742 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002351  sulfite reductase [NADPH] hemoprotein beta-component  72.86 
 
 
578 aa  879    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0210403  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2796  sulfite reductase subunit beta  72.73 
 
 
577 aa  878    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000451372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03588  sulfite reductase subunit beta  72.6 
 
 
573 aa  889    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0403  sulfite reductase subunit beta  71.3 
 
 
576 aa  881    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00409263  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0811  sulfite reductase subunit beta  85.11 
 
 
571 aa  1032    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0828  sulfite reductase subunit beta  90.72 
 
 
571 aa  1095    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0777  sulfite reductase subunit beta  57.37 
 
 
594 aa  691    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4017  sulfite reductase subunit beta  80.74 
 
 
570 aa  993    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.96721  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3526  sulfite reductase subunit beta  86.16 
 
 
577 aa  1050    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.19432  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3415  sulfite reductase subunit beta  58.19 
 
 
565 aa  701    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3441  sulfite reductase subunit beta  83.54 
 
 
576 aa  1021    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25109  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0920  sulfite reductase subunit beta  58.19 
 
 
565 aa  701    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0933  sulfite reductase subunit beta  58.5 
 
 
562 aa  694    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0949  sulfite reductase subunit beta  80.56 
 
 
570 aa  992    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0217  sulfite reductase subunit beta  70.92 
 
 
566 aa  858    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0945  sulfite reductase subunit beta  58.19 
 
 
565 aa  701    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3226  sulfite reductase subunit beta  81.26 
 
 
570 aa  991    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.73638  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4038  sulfite reductase subunit beta  70.82 
 
 
569 aa  868    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00004  sulfite reductase subunit beta  73.31 
 
 
578 aa  878    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2903  sulfite reductase subunit beta  80.91 
 
 
570 aa  994    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3079  sulfite reductase subunit beta  59.07 
 
 
565 aa  707    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0893  sulfite reductase subunit beta  59.07 
 
 
565 aa  708    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3310  sulfite reductase subunit beta  83.54 
 
 
576 aa  1021    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3192  sulfite reductase subunit beta  57.5 
 
 
563 aa  684    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0666  sulfite reductase subunit beta  57.5 
 
 
565 aa  690    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000528094 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3306  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein, beta-component  69.23 
 
 
564 aa  841    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3063  sulfite reductase subunit beta  58.01 
 
 
565 aa  701    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0856  sulfite reductase subunit beta  59.07 
 
 
565 aa  708    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3364  sulfite reductase subunit beta  86.51 
 
 
577 aa  1056    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2838  sulfite reductase subunit beta  70.28 
 
 
571 aa  853    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02571  hypothetical protein  80.56 
 
 
570 aa  992    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3435  sulfite reductase subunit beta  63.86 
 
 
562 aa  754    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387286 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2201  sulfite reductase subunit beta  53.18 
 
 
573 aa  640    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1306  sulfite reductase subunit beta  49.64 
 
 
579 aa  580  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.482907  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2237  sulfite reductase subunit beta  50.55 
 
 
657 aa  560  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.327288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1783  sulfite reductase subunit beta  48.32 
 
 
616 aa  559  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2513  sulfite reductase subunit beta  50.55 
 
 
612 aa  561  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1804  sulfite reductase subunit beta  49.1 
 
 
602 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02132  sulfite reductase subunit beta  51.91 
 
 
568 aa  557  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130377  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2195  sulfite reductase subunit beta  49.91 
 
 
612 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5484  sulfite reductase subunit beta  49.55 
 
 
602 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2695  sulfite reductase subunit beta  50.81 
 
 
575 aa  551  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0702337  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05500  sulfite reductase, putative  47.19 
 
 
1885 aa  546  1e-154  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0751  sulfite reductase subunit beta  50.27 
 
 
568 aa  546  1e-154  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2426  sulfite reductase subunit beta  50.18 
 
 
578 aa  548  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0422981 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0838  sulfite reductase subunit beta  50.27 
 
 
568 aa  547  1e-154  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88562  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2190  sulfite reductase subunit beta  47.04 
 
 
572 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0591  sulfite reductase subunit beta  49.91 
 
 
576 aa  533  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0776891  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3122  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  47.66 
 
 
563 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2721  Sulfite reductase (NADPH)  47.66 
 
 
563 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000160645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0683  sulfite reductase subunit beta  49.18 
 
 
576 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07600  SE, putative sulfite reductase beta subunit-hemoprotein,ferredoxin oxidoreductase (Eurofung)  45.47 
 
 
1528 aa  520  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  0.178099 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2799  sulfite reductase subunit beta  46.56 
 
 
557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507806  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67906  Sulfite reductase [NADPH] beta subunit (Extracellular matrix protein 17)  43.27 
 
 
934 aa  492  9.999999999999999e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0700093 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2432  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  45.44 
 
 
581 aa  471  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3309  hypothetical protein  38.95 
 
 
562 aa  420  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.586333  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1294  Sulfite reductase (NADPH)  38.25 
 
 
546 aa  412  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2423  Sulfite reductase (NADPH)  38.88 
 
 
560 aa  391  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.230448  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0852  Sulfite reductase (NADPH)  36.73 
 
 
566 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2758  Sulfite reductase (NADPH)  36.96 
 
 
571 aa  384  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36234  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1667  sulfite reductase subunit beta  36.44 
 
 
638 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1640  sulfite reductase subunit beta  36.27 
 
 
638 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2931  sulfite reductase subunit beta  35.12 
 
 
646 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5043  sulfite reductase subunit beta  36.25 
 
 
650 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3544  sulfite reductase subunit beta  35.66 
 
 
902 aa  368  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0019  sulfite reductase subunit beta  36.72 
 
 
624 aa  363  5.0000000000000005e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.508034 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5022  sulfite reductase, ferredoxin dependent  36.93 
 
 
637 aa  361  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.299313  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3868  sulfite reductase subunit beta  35.9 
 
 
660 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24374  predicted protein  32.69 
 
 
633 aa  322  9.999999999999999e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.152438  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_25282  sulfite reductase  33.51 
 
 
690 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16711  sulfite reductase subunit beta  32.57 
 
 
598 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08251  sulfite reductase subunit beta  31.87 
 
 
596 aa  295  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0766  sulfite reductase subunit beta  31.68 
 
 
595 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.958456  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1242  sulfite reductase subunit beta  33.16 
 
 
580 aa  286  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.704762  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08181  sulfite reductase subunit beta  31.73 
 
 
595 aa  284  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.900462  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1227  sulfite reductase subunit beta  33.45 
 
 
580 aa  283  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.447806 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08201  sulfite reductase subunit beta  31.39 
 
 
595 aa  283  9e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07941  sulfite reductase subunit beta  31.41 
 
 
601 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0162  sulfite reductase subunit beta  31.59 
 
 
601 aa  279  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.75375  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10051  sulfite reductase subunit beta  29.67 
 
 
598 aa  279  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.155233  normal  0.609504 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0705  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.49 
 
 
630 aa  184  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0961  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  27.59 
 
 
599 aa  154  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000332395  normal  0.245939 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  26.21 
 
 
510 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  28.16 
 
 
556 aa  136  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.159601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>