More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0757 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0757  glycoside hydrolase family 1  100 
 
 
478 aa  996    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.778276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0737  glycoside hydrolase family 1  88.7 
 
 
478 aa  900    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3281  glycoside hydrolase family protein  75.52 
 
 
475 aa  755    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.69371  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3468  glycoside hydrolase family 1  84.1 
 
 
478 aa  858    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2609  glycosy hydrolase family protein  45.08 
 
 
459 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2295  beta-glucosidase a  45.08 
 
 
459 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4095  glycoside hydrolase family 1  42.98 
 
 
469 aa  408  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.362343  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  44.01 
 
 
459 aa  383  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  43.45 
 
 
470 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  43.45 
 
 
464 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1473  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  41.09 
 
 
475 aa  377  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.27545  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1586  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  40.6 
 
 
479 aa  378  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.816968  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  42.6 
 
 
460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  42.38 
 
 
460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  42.6 
 
 
460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  42.38 
 
 
460 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  42.38 
 
 
460 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0682  glycoside hydrolase family 1  39.39 
 
 
461 aa  355  1e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0030  Beta-glucosidase  41.89 
 
 
470 aa  355  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  41 
 
 
457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0035  Beta-glucosidase  41.89 
 
 
465 aa  350  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  40.61 
 
 
461 aa  345  7e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  41.39 
 
 
461 aa  343  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  40.53 
 
 
462 aa  342  7e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3120  Beta-glucosidase  39.47 
 
 
460 aa  335  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.29426  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3201  Beta-glucosidase  37.95 
 
 
470 aa  335  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.281249  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl425  beta-glucosidase  35.51 
 
 
452 aa  291  2e-77  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00336379  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  37.53 
 
 
465 aa  288  1e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  33.26 
 
 
448 aa  232  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  34.04 
 
 
469 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  31.05 
 
 
467 aa  229  7e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  32.4 
 
 
453 aa  228  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  31.26 
 
 
451 aa  226  8e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  32.32 
 
 
459 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  32.17 
 
 
467 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  31.04 
 
 
468 aa  219  7.999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  30.52 
 
 
489 aa  217  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  32.84 
 
 
478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  33.55 
 
 
476 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  29.89 
 
 
471 aa  213  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  32.35 
 
 
472 aa  210  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  29.31 
 
 
474 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  31.05 
 
 
470 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  31.91 
 
 
479 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  31.42 
 
 
473 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  34.29 
 
 
450 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  31.91 
 
 
463 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  29.11 
 
 
478 aa  207  5e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  31.39 
 
 
455 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  31.92 
 
 
450 aa  206  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  31.77 
 
 
469 aa  206  8e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  29.15 
 
 
446 aa  206  9e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  30.56 
 
 
465 aa  205  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  30.41 
 
 
446 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  31.88 
 
 
465 aa  203  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  31.82 
 
 
484 aa  203  6e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000215907  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  30.41 
 
 
446 aa  203  7e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  30.62 
 
 
438 aa  202  9e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  31.87 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  30.49 
 
 
487 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  33.12 
 
 
482 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  30.28 
 
 
909 aa  201  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  31.97 
 
 
474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  33.62 
 
 
444 aa  201  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  33.7 
 
 
458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1584  glycoside hydrolase family 1  29.18 
 
 
451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  30.57 
 
 
452 aa  200  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  31.39 
 
 
488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  30.18 
 
 
439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  29.15 
 
 
452 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2547  glycoside hydrolase family 1  28.8 
 
 
479 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0806308  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  32.9 
 
 
458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  27.37 
 
 
475 aa  197  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3733  glycoside hydrolase family 1  32.44 
 
 
478 aa  196  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  31.97 
 
 
478 aa  196  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  29.64 
 
 
446 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  31.03 
 
 
494 aa  196  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3567  glycoside hydrolase family 1  32.71 
 
 
478 aa  196  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  30.17 
 
 
478 aa  195  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  29.83 
 
 
467 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  31.7 
 
 
470 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06724  phospho-beta-glucosidase B  32.01 
 
 
463 aa  194  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  33.12 
 
 
458 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  31.99 
 
 
471 aa  193  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0791  6-phospho-beta-glucosidase  31 
 
 
475 aa  193  7e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.240964  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl617  6-phospho-beta-glucosidase  30.34 
 
 
466 aa  191  2e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1352  glycoside hydrolase family 1  30.71 
 
 
471 aa  191  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0469  6-phospho-beta-glucosidase  30.12 
 
 
478 aa  191  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  32.04 
 
 
482 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0889  glycoside hydrolase family 1  31.39 
 
 
480 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  30.77 
 
 
470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000818  6-phospho-beta-glucosidase  31.29 
 
 
463 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490689  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1407  glycoside hydrolase family 1  31.99 
 
 
464 aa  190  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2500  glycoside hydrolase family protein  30.61 
 
 
478 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0765  6-phospho-beta-glucosidase  31.72 
 
 
465 aa  190  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  30.63 
 
 
453 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0927  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  30.86 
 
 
478 aa  190  5e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3034  6-phospho-beta-glucosidase BglA  29.84 
 
 
479 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3322  6-phospho-beta-glucosidase BglA  29.96 
 
 
479 aa  190  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4193  6-phospho-beta-glucosidase BglA  29.63 
 
 
479 aa  189  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>