More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0704 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  100 
 
 
286 aa  548  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  85.56 
 
 
284 aa  463  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  79.58 
 
 
284 aa  431  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  79.23 
 
 
284 aa  427  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  73.68 
 
 
285 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  56.64 
 
 
290 aa  302  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  58.01 
 
 
290 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  63.37 
 
 
287 aa  296  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  63.67 
 
 
290 aa  295  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  59.79 
 
 
289 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  59.44 
 
 
289 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  57.14 
 
 
289 aa  292  5e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  61.51 
 
 
290 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  59.57 
 
 
284 aa  288  5.0000000000000004e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  54.17 
 
 
290 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  56.45 
 
 
291 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  56.38 
 
 
290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  56.34 
 
 
296 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  55.36 
 
 
289 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  59.57 
 
 
290 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  60.07 
 
 
290 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  55.96 
 
 
291 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  54.55 
 
 
299 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  57.62 
 
 
300 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  57.14 
 
 
294 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  57.09 
 
 
290 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  52.65 
 
 
293 aa  266  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  61.6 
 
 
290 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  52.78 
 
 
290 aa  265  8.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  57.3 
 
 
295 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  58.39 
 
 
295 aa  259  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  58.03 
 
 
295 aa  258  7e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  55.79 
 
 
289 aa  257  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  53.17 
 
 
291 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  57.74 
 
 
288 aa  255  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  55.2 
 
 
288 aa  252  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  56.12 
 
 
288 aa  249  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  56.23 
 
 
288 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  49.45 
 
 
290 aa  239  5.999999999999999e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  49.3 
 
 
288 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  55.56 
 
 
304 aa  235  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  55.52 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  35.23 
 
 
280 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  33.22 
 
 
289 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  31.91 
 
 
288 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  38.87 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  30.96 
 
 
288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  30.96 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  34.51 
 
 
312 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.41 
 
 
279 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  37.25 
 
 
306 aa  142  9e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.62 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  33.71 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  31.64 
 
 
288 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  31.64 
 
 
288 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  30.77 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  29.89 
 
 
278 aa  135  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  29.89 
 
 
278 aa  135  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  31.14 
 
 
297 aa  135  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  31.14 
 
 
297 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  31.14 
 
 
297 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  31.58 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 
278 aa  133  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  32.16 
 
 
300 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  33.46 
 
 
285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  30.47 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  33.8 
 
 
278 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  29.08 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  30.88 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  33.58 
 
 
281 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  32.52 
 
 
291 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  31.73 
 
 
280 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  32.59 
 
 
275 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  30.47 
 
 
285 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  31.71 
 
 
278 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  30.14 
 
 
290 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  30.14 
 
 
290 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  31.71 
 
 
278 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  30 
 
 
415 aa  122  7e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  32.13 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  33.21 
 
 
303 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  36.52 
 
 
295 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  29.18 
 
 
294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  33.91 
 
 
312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  31.58 
 
 
287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  31.07 
 
 
277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  28.62 
 
 
286 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  33.2 
 
 
285 aa  119  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  32.16 
 
 
285 aa  119  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  32.74 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  33.73 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  30.39 
 
 
276 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  32.38 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  33.22 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  32.87 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  30.04 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  33.45 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  29.86 
 
 
283 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  29.24 
 
 
281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  33.85 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>