More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0526 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0526  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  924    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2090  hypothetical protein  80.41 
 
 
438 aa  726    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59319  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0408  hypothetical protein  83.48 
 
 
458 aa  776    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2489  hypothetical protein  85 
 
 
442 aa  789    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1187  hypothetical protein  76.1 
 
 
441 aa  669    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2149  hypothetical protein  85.91 
 
 
442 aa  794    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21890  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  59.63 
 
 
443 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  58.16 
 
 
441 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  57.24 
 
 
448 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3862  flavin-dependent oxidoreductase  58.43 
 
 
452 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691783  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4430  flavin-dependent oxidoreductase  57.53 
 
 
450 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240146  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5875  flavin-dependent oxidoreductase  57.73 
 
 
450 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  56.32 
 
 
448 aa  511  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1697  flavin-dependent oxidoreductase  57.14 
 
 
447 aa  514  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.368997  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1532  flavin-dependent oxidoreductase  57.05 
 
 
450 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  56.21 
 
 
444 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3936  flavin-dependent oxidoreductase  57.93 
 
 
439 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4322  flavin-dependent oxidoreductase  59.26 
 
 
441 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1689  nitrilotriacetate monooxygenase component A  58.08 
 
 
440 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4189  flavin-dependent oxidoreductase  59.73 
 
 
450 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0738  nitrilotriacetate monooxygenase component A  58.08 
 
 
440 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0563  nitrilotriacetate monooxygenase component A  58.08 
 
 
440 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2404  flavin-dependent oxidoreductase  58.08 
 
 
440 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878238  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2267  flavin-dependent oxidoreductase  58.08 
 
 
440 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1891  nitrilotriacetate monooxygenase component A  58.08 
 
 
440 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1683  nitrilotriacetate monooxygenase component A  58.08 
 
 
440 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0395  putative monooxygenase  56.88 
 
 
444 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  56.36 
 
 
451 aa  500  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4354  putative nitrilotriacetate monooxygenase component  54.67 
 
 
449 aa  498  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5198  monooxygenase  57.48 
 
 
430 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5561  putative nitrilotriacetate monooxygenase protein component A  54.69 
 
 
449 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.200364  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  53.33 
 
 
442 aa  475  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  53.46 
 
 
445 aa  478  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0232  putative monooxygenase  52.75 
 
 
438 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2295  nitrilotriacetate monooxygenase component A  53.05 
 
 
449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3053  putative monooxygenase  52.6 
 
 
449 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2001  putative monooxygenase  52.6 
 
 
449 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1398  nitrilotriacetate monooxygenase  52.6 
 
 
449 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3181  putative monooxygenase  52.6 
 
 
449 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1311  putative monooxygenase  52.6 
 
 
449 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1023  putative monooxygenase  52.6 
 
 
449 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0217673  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2289  putative monooxygenase  52.37 
 
 
449 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1224  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  50.12 
 
 
449 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  48.65 
 
 
454 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  47.53 
 
 
457 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  47.73 
 
 
439 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  47.06 
 
 
455 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  46.71 
 
 
441 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  48.79 
 
 
457 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3218  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  47.48 
 
 
439 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  46.17 
 
 
457 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  46.26 
 
 
441 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4104  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.48 
 
 
478 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.958651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  46.88 
 
 
457 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  46.26 
 
 
460 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2515  putative nitrilotriacetate monooxygenase, component A  47.34 
 
 
435 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.261163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  46.71 
 
 
442 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  44.82 
 
 
458 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  45.13 
 
 
458 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  46.71 
 
 
445 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  44.54 
 
 
449 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.49 
 
 
445 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  44.27 
 
 
453 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.7 
 
 
452 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.74 
 
 
456 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  46.35 
 
 
448 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  44.06 
 
 
452 aa  364  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  45.43 
 
 
450 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.48 
 
 
452 aa  358  8e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  43.62 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.3 
 
 
445 aa  358  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  44.52 
 
 
450 aa  357  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  44.47 
 
 
454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  45.31 
 
 
450 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  41.69 
 
 
446 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  44.87 
 
 
450 aa  356  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  42.98 
 
 
448 aa  355  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  46.26 
 
 
474 aa  354  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.47 
 
 
448 aa  353  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  43.57 
 
 
448 aa  349  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  44.52 
 
 
450 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  42.7 
 
 
441 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  45.21 
 
 
434 aa  345  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  43.89 
 
 
440 aa  342  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  45.08 
 
 
442 aa  342  9e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  42.92 
 
 
436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  43.24 
 
 
458 aa  339  5e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  42.73 
 
 
440 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  42.63 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  42.92 
 
 
441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  42.86 
 
 
445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  41.89 
 
 
445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  42.89 
 
 
444 aa  336  5e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  42.73 
 
 
449 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.69 
 
 
447 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.43 
 
 
440 aa  334  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  42.86 
 
 
444 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  42.66 
 
 
444 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.27 
 
 
439 aa  332  7.000000000000001e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  43.02 
 
 
492 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>