157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0510 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0510  flavodoxin FldA  100 
 
 		 176 aa  362  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1483  flavodoxin FldA  57.95 
 
 		 177 aa  213  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.760542 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1697  flavodoxin FldA  53.41 
 
 		 178 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01710  Flavodoxin, nifF  54.86 
 
 		 180 aa  199  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3186  hypothetical protein  50.87 
 
 		 180 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155637  normal  0.897165 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1457  flavodoxin FldA  45.51 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1576  flavodoxin FldA  44.77 
 
 		 174 aa  144  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00641  flavodoxin 1  45.2 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2953  flavodoxin  45.2 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000283626  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0706  flavodoxin FldA  45.2 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000789352  normal  0.640878 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00632  hypothetical protein  45.2 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000788161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0779  flavodoxin FldA  45.2 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000185932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2972  flavodoxin FldA  45.2 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000017596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0566  flavodoxin FldA  46.24 
 
 		 215 aa  140  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.83272e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0731  flavodoxin FldA  46.24 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.8987999999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0712  flavodoxin FldA  46.24 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2901  flavodoxin FldA  42.05 
 
 		 175 aa  140  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.63473e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0321  flavodoxin FldA  42.05 
 
 		 175 aa  140  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000460147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2990  flavodoxin FldA  42.05 
 
 		 175 aa  140  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000344079  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0753  flavodoxin FldA  44.63 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  normal  0.213814 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2045  flavodoxin  41.52 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000806437  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0814  flavodoxin FldA  44.63 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000448874  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0741  flavodoxin FldA  44.63 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0801  flavodoxin FldA  44.63 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000015287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0850  flavodoxin FldA  44.63 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000167228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0164  flavodoxin FldA  41.71 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.243866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1199  flavodoxin FldA  44.63 
 
 		 176 aa  138  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000181933  hitchhiker  0.00018565 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1685  flavodoxin FldA  42.44 
 
 		 175 aa  138  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000671882  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1701  flavodoxin FldA  43.6 
 
 		 175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000646735  hitchhiker  0.00968466 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0860  flavodoxin  41.86 
 
 		 169 aa  137  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000640171  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2036  flavodoxin FldA  43.6 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000119946  hitchhiker  0.000146054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1939  flavodoxin FldA  43.6 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000709985  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2139  flavodoxin FldA  43.6 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000959174  decreased coverage  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1210  flavodoxin FldA  42.44 
 
 		 174 aa  137  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.209956  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0757  flavodoxin  41.14 
 
 		 168 aa  136  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.66509  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2330  flavodoxin FldA  43.02 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2938  flavodoxin  42.61 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0248882  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2270  flavodoxin  42.61 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000283187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0835  flavodoxin FldA  42.37 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1877  flavodoxin FldA  43.02 
 
 		 175 aa  134  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000140867  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1237  flavodoxin  42.61 
 
 		 179 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2051  flavodoxin FldA  42.05 
 
 		 175 aa  135  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000064376  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1118  flavodoxin  43.02 
 
 		 175 aa  134  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004124  flavodoxin 1  42.53 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000570149  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1917  flavodoxin FldA  43.02 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000679628  unclonable  0.00000189702 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3124  flavodoxin FldA  42.44 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000347924  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1910  flavodoxin FldA  41.86 
 
 		 175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000190222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2243  flavodoxin FldA  42.44 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000503169  decreased coverage  0.0000000000344478 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4516  flavodoxin FldA  42.44 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2230  flavodoxin FldA  42.44 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2141  flavodoxin FldA  42.44 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000052046  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1207  flavodoxin FldA  42.77 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000563354  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2191  flavodoxin FldA  42.44 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000015331  unclonable  0.00000416512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  38.98 
 
 		 169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01341  flavodoxin FldA  41.38 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2151  flavodoxin FldA  40.11 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1541  flavodoxin FldA  39.08 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325329  normal  0.0252615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2337  flavodoxin  41.24 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000157919  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1990  flavodoxin FldA  41.28 
 
 		 175 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0798  flavodoxin  39.18 
 
 		 168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0874  flavodoxin  40.12 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01086  flavodoxin FldA  38.42 
 
 		 174 aa  127  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000199126  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1724  ATPase  39.31 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1365  flavodoxin, long chain  38.2 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180035  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32110  flavodoxin FldA  40.83 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0557  flavodoxin  41.28 
 
 		 168 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.313474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2877  flavodoxin  40.34 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.132846 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00955  flavodoxin FldB  39.08 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4096  flavodoxin FldB  40.12 
 
 		 172 aa  121  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004442  flavodoxin 2  39.53 
 
 		 172 aa  120  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1996  flavodoxin FldB  36.99 
 
 		 198 aa  120  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03642  flavodoxin FldB  37.14 
 
 		 178 aa  120  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00831725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2408  flavodoxin FldA  39.05 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0076  flavodoxin FldA  38.46 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.326568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0832  flavodoxin FldA  41.07 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3536  flavodoxin  40 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000193054  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1929  flavodoxin FldA  38.82 
 
 		 163 aa  119  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314871  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2656  flavodoxin FldA  40.24 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0324  flavodoxin  39.2 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3846  flavodoxin FldB  38.37 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.51056 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0881  flavodoxin FldB  38.37 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3173  flavodoxin FldA  37.87 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46972  flavodoxin  37.64 
 
 		 324 aa  115  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4067  flavodoxin FldB  37.71 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0878  flavodoxin FldB  37.79 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.182784  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0409  flavodoxin FldA  38.6 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3428  flavodoxin FldB  35.67 
 
 		 172 aa  114  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3028  flavodoxin FldB  36.84 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0095  flavodoxin  39.66 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0268  flavodoxin FldA  38.6 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3313  flavodoxin FldB  37.43 
 
 		 173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02727  flavodoxin 2  36.26 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.340872  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0797  flavodoxin  36.26 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1573  flavodoxin FldA  38.6 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.698699  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02690  hypothetical protein  36.26 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391992  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3315  flavodoxin FldB  36.26 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4186  flavodoxin FldB  36.26 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3054  flavodoxin FldB  36.26 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3221  flavodoxin FldB  36.26 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0814  flavodoxin FldB  36.26 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.200628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>