69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0499 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0499  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  100 
 
 
155 aa  319  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01480  Nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifX  40.71 
 
 
158 aa  97.1  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1506  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.21 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0235  nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  34.62 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00441901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4458  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  38.83 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1193  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.62 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1078  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.92 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1515  nitrogen fixation protein NifX  33.65 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19909  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1472  nitrogen fixation-related protein (NifX)  31.62 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437364  decreased coverage  0.0000979183 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1233  nitrogen fixation protein NifX  33.65 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000802968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6876  nitrogen fixation protein NifX  33.04 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3934  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.44 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0518816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3627  nitrogen fixation protein NifX  31.73 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184482 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2323  nitrogen fixation protein NifX  32.69 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0653956  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0974  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  35.58 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649686  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5920  nitrogenase molybdenum-iron protein nifX  31.62 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0478  nitrogen fixation protein NifX  35.58 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1351  nitrogen fixation protein NifX  29.46 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0265  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.28 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5096  nitrogen fixation protein NifX  33.01 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1790  nitrogen fixation protein NifX  33.71 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1818  nitrogen fixation protein NifX  33.71 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1202  nitrogen fixation protein NifX  23.81 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120985  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4052  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.71 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0093  nitrogen fixation protein NifX  32.04 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.071454  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2805  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifX  28.12 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1054  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.13 
 
 
123 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1348  nitrogen fixation protein NifX  32.22 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802033  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4252  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.73 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4798  nitrogen fixation protein NifX  31.11 
 
 
138 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0671  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.17 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1058  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4483  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.43 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2114  nitrogen fixation protein NifX  31.46 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083007 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50910  Nitrogen fixation-related protein, gamma subunit  30 
 
 
243 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0585445  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1251  nitrogen fixation protein NifX  23.97 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7731  nitrogen fixation protein NifX  34.44 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1036  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.46 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0634  nitrogen fixation protein NifX  24.27 
 
 
128 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1410  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.11 
 
 
243 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2101  nitrogen fixation protein NifX  23.48 
 
 
119 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2284  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  24.83 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4140  nitrogen fixation protein NifX  30.11 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.480569  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6221  nitrogen fixation protein NifX  20.54 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.550036  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0460  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  26.61 
 
 
168 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2188  nitrogen fixation protein NifX  22.4 
 
 
144 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.141271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3991  nitrogen fixation protein NifX  23.62 
 
 
163 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02740  nitrogenase biosynthetic protein vnfX  25.37 
 
 
182 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0270  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  24.82 
 
 
247 aa  50.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2140  nitrogen fixation protein NifX  21.88 
 
 
129 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1565  nitrogen fixation protein NifX  21.31 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0536  putative nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  21.31 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3539  nitrogen fixation protein NifX  22.05 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.89885  decreased coverage  0.00377232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2078  nitrogen fixation protein NifX  21.67 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3026  nitrogen fixation protein NifX  23.3 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48700  Metallocluster binding protein of the NafY/NifY/NifX/VnfX family  29.67 
 
 
120 aa  48.5  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1455  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.16 
 
 
247 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01420  Nitrogenase iron molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.1 
 
 
242 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3490  nitrogen fixation protein NifX  21.49 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1796  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.27 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2103  putative nitrogen fixation protein  30.7 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1206  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  29.79 
 
 
464 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.65726  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0665  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  28.41 
 
 
106 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.482499  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0105  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.41 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.314032  normal  0.119899 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2138  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.58 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00514966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02570  nitrogen fixation-related protein, vnfY  24.32 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0717484  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0058  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  22.73 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0199747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0631  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.89 
 
 
110 aa  42.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2080  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.46 
 
 
109 aa  40.8  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>