60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0455 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  927  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1135  hypothetical protein  55.68 
 
 
447 aa  504  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.879789  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  25.53 
 
 
440 aa  62.4  1e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  35.63 
 
 
430 aa  60.5  6e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.19 
 
 
634 aa  56.6  9e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  32.19 
 
 
251 aa  55.8  1e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  29.59 
 
 
464 aa  56.2  1e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  21.99 
 
 
442 aa  56.2  1e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  26.09 
 
 
505 aa  55.8  2e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  24.15 
 
 
577 aa  55.8  2e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  33.61 
 
 
454 aa  55.5  2e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  36 
 
 
422 aa  54.7  3e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  37.04 
 
 
482 aa  54.3  5e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  49.02 
 
 
410 aa  53.1  1e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  30.61 
 
 
445 aa  52.8  1e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  29 
 
 
736 aa  52  2e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  40.62 
 
 
421 aa  52  2e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  30.77 
 
 
584 aa  52.4  2e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  36.08 
 
 
427 aa  52  2e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  26.8 
 
 
712 aa  51.6  3e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  34.55 
 
 
452 aa  51.6  3e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  8.89729e-09  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  29.17 
 
 
445 aa  51.6  3e-05  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  42.86 
 
 
437 aa  51.2  4e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  44.9 
 
 
562 aa  50.8  5e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  48.98 
 
 
203 aa  50.4  7e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  43.4 
 
 
422 aa  50.1  8e-05  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  45.1 
 
 
423 aa  50.1  8e-05  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  25.95 
 
 
588 aa  50.1  9e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  35 
 
 
439 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  38.33 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  34.62 
 
 
553 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.47 
 
 
616 aa  49.7  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  34.71 
 
 
540 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  26.67 
 
 
452 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  27.32 
 
 
582 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  37.08 
 
 
415 aa  47.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  31.03 
 
 
455 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  35 
 
 
552 aa  47.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  44.9 
 
 
769 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  31.45 
 
 
420 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  34.52 
 
 
553 aa  47  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.24865e-06 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  46.81 
 
 
449 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  36.67 
 
 
406 aa  46.6  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  27.27 
 
 
478 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  22.93 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  29.2 
 
 
709 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  27.08 
 
 
634 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  35.29 
 
 
257 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  26.76 
 
 
610 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 
553 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  38.6 
 
 
408 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  37.04 
 
 
619 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  28.87 
 
 
276 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.79 
 
 
613 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  29.51 
 
 
414 aa  44.3  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  27.78 
 
 
628 aa  44.3  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  22.66 
 
 
369 aa  44.3  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  27.66 
 
 
666 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  37.84 
 
 
554 aa  43.5  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  32.99 
 
 
410 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>