More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0446 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0446  putative transferase  100 
 
 
178 aa  356  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000031956  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  80.9 
 
 
178 aa  295  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3782  putative transferase  76.84 
 
 
182 aa  277  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3961  putative transferase  76.57 
 
 
182 aa  275  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000707478  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3665  hypothetical protein  71.35 
 
 
256 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000398302  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3763  hypothetical protein  71.35 
 
 
293 aa  271  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000274593  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3473  hypothetical protein  71.35 
 
 
256 aa  271  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.93281e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0434  putative transferase  71.35 
 
 
184 aa  268  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000121267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0434  putative transferase  71.35 
 
 
184 aa  268  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000608739  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4603  hypothetical protein  71.35 
 
 
184 aa  268  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254067  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4505  putative transferase  71.91 
 
 
180 aa  268  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187962  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3576  hypothetical protein  70.79 
 
 
184 aa  267  7e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128421  normal  0.244838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03130  hypothetical protein  70.79 
 
 
184 aa  266  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000042792  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03081  hypothetical protein  70.79 
 
 
184 aa  266  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3711  putative transferase  70.22 
 
 
184 aa  259  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000368449  normal  0.0573377 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  70.79 
 
 
180 aa  255  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000022748  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  70.79 
 
 
180 aa  255  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  70.79 
 
 
180 aa  255  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  65.54 
 
 
184 aa  238  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000149932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0042  carbonic anhydrase  62.92 
 
 
182 aa  236  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0039  carbonic anhydrase  61.24 
 
 
182 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000072443  hitchhiker  0.000629469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0045  carbonic anhydrase  61.8 
 
 
182 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.0000010839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0037  carbonic anhydrase  61.24 
 
 
182 aa  232  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000433363  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  62.43 
 
 
180 aa  231  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002069  carbonic anhydrase family 3  63.22 
 
 
182 aa  230  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000548613  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00380  hypothetical protein  62.64 
 
 
183 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0042  carbonic anhydrase  61.93 
 
 
182 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000454133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0037  carbonic anhydrase  61.93 
 
 
182 aa  229  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  63.01 
 
 
180 aa  229  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0041  carbonic anhydrase  61.93 
 
 
182 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000411727  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0037  carbonic anhydrase  60.8 
 
 
181 aa  229  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000544891  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0041  carbonic anhydrase, family 3  61.93 
 
 
182 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000508164  unclonable  0.00000000000448586 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0054  carbonic anhydrase  58.99 
 
 
182 aa  228  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000373213  normal  0.14059 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0045  carbonic anhydrase  60.92 
 
 
184 aa  227  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000362772  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01130  Trimeric LpxA-like superfamily protein  63.58 
 
 
192 aa  227  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0034  carbonic anhydrase  61.36 
 
 
182 aa  226  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000602369  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3725  carbonic anhydrase  57.87 
 
 
185 aa  226  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00601402  hitchhiker  0.00871836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0033  carbonic anhydrase/acetyltransferase  60.34 
 
 
177 aa  225  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000120925  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0401  anhydrase family 3 protein  58.05 
 
 
179 aa  223  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  59.54 
 
 
182 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0042  carbonic anhydrase  60.92 
 
 
185 aa  221  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000058127  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4460  carbonic anhydrase  59.65 
 
 
180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0053  anhydrase family 3 protein  58.19 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0319  hexapaptide repeat-containing transferase  60.34 
 
 
179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0032  transferase hexapeptide domain-containing protein  60.34 
 
 
179 aa  218  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0044  hexapaptide repeat-containing transferase  57.23 
 
 
181 aa  216  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0036  carbonic anhydrase  57.39 
 
 
184 aa  216  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906421  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00032  putative carbonic anhydrase/acetyltransferase  59.55 
 
 
180 aa  215  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00477036  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0095  anhydrase family 3 protein  57.8 
 
 
182 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0110  carbonic anhydrase  57.8 
 
 
182 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0085  putative transferase  58.43 
 
 
181 aa  214  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000367586  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0145  hypothetical protein  57.23 
 
 
181 aa  214  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0091  hexapaptide repeat-containing transferase  57.47 
 
 
181 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0110  transferase  57.23 
 
 
182 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0049  carbonic anhydrase  58.43 
 
 
180 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044877  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0030  anhydrase family 3 protein  56.14 
 
 
185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  55.49 
 
 
180 aa  207  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0233  carbonic anhydrase  56.74 
 
 
179 aa  204  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00386498  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  54.02 
 
 
176 aa  203  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0629  hypothetical protein  53.49 
 
 
178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1122  putative transferase  55.15 
 
 
179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000279572  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0613  hypothetical protein  53.18 
 
 
177 aa  195  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2797  carbonic anhydrase  54.97 
 
 
180 aa  194  7e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  53.29 
 
 
185 aa  191  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3842  transferase  50.58 
 
 
176 aa  187  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2395  hexapaptide repeat-containing transferase  50 
 
 
176 aa  186  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2432  carbonic anhydrase  53.89 
 
 
189 aa  186  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0151  hexapaptide repeat-containing transferase  48.24 
 
 
179 aa  177  8e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.240687  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0870  transferase  48.55 
 
 
187 aa  175  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0989  transferase  48.55 
 
 
187 aa  175  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03943  transferase  49.12 
 
 
181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  46.78 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0106  carbonic anhydrase family 3  51.22 
 
 
187 aa  171  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  49.14 
 
 
174 aa  169  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0223  hypothetical protein  48.55 
 
 
169 aa  165  4e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  44.57 
 
 
179 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  44.25 
 
 
177 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000167215  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1604  hexapaptide repeat-containing transferase  47.95 
 
 
175 aa  159  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3520  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  45.4 
 
 
177 aa  157  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0123178  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  43.35 
 
 
175 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  43.35 
 
 
175 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  45.4 
 
 
177 aa  157  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000371733  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  42.77 
 
 
175 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  44.25 
 
 
177 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0280  hexapaptide repeat-containing transferase  44.57 
 
 
182 aa  155  4e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.801626  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0773  hexapaptide repeat-containing transferase  43.93 
 
 
178 aa  154  4e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0167469  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0228  hexapaptide repeat-containing transferase  45.14 
 
 
182 aa  154  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0254  hexapaptide repeat-containing transferase  45.14 
 
 
182 aa  154  9e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1579  hexapaptide repeat-containing transferase  44.85 
 
 
175 aa  149  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2271  acetyltransferase  44.58 
 
 
173 aa  148  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1678  carbonic anhydrase  38.07 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3324  hexapeptide transferase family protein  40 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  46.3 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0249  acetyltransferase  44.31 
 
 
177 aa  145  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  48.77 
 
 
174 aa  145  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0011  acetyltransferase/carbonic anhydrase  41.07 
 
 
169 aa  144  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0290  acetyltransferase  45.51 
 
 
180 aa  143  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0175113 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1414  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.82 
 
 
169 aa  143  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000109876  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2541  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  44.31 
 
 
171 aa  143  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1206  carbonic anhydrase  43.43 
 
 
171 aa  143  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.099516  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>