More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0289 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 		 106 aa  220  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  83.02 
 
 		 106 aa  193  8.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  80.95 
 
 		 107 aa  184  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  79.61 
 
 		 107 aa  179  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  66.35 
 
 		 108 aa  149  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  61.32 
 
 		 109 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  61.32 
 
 		 109 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  61.32 
 
 		 109 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  61.54 
 
 		 110 aa  140  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  59.81 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  59.81 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  59.81 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  59.81 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  59.81 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  57.94 
 
 		 108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  57.94 
 
 		 108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.155763 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  57.94 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  57.94 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  57.94 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  57.94 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  57.94 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  57.01 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  57.01 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  56.07 
 
 		 110 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  55.14 
 
 		 110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  55.14 
 
 		 110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  51.89 
 
 		 106 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  53.77 
 
 		 109 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  51.89 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  51.89 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  56.86 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  54.46 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  51.89 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  54.9 
 
 		 106 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  51.89 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  54 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  54.72 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  47.62 
 
 		 110 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  46.67 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 102 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  52.87 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  50 
 
 		 101 aa  104  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  48.98 
 
 		 101 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  48.98 
 
 		 101 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  48.98 
 
 		 101 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  48.98 
 
 		 101 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  48.98 
 
 		 123 aa  104  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 101 aa  103  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  59.21 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  48.98 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  56.58 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  41.75 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  46.46 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  45.92 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  44.44 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  47.42 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  46.94 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  46.43 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  50.63 
 
 		 245 aa  89.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  45.74 
 
 		 263 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  44 
 
 		 103 aa  84.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  46.99 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  42.11 
 
 		 260 aa  77.4  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 		 260 aa  77.4  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  40.62 
 
 		 656 aa  74.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  43.59 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  36.84 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  41.05 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  39.47 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  32.32 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  42.25 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  39.47 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 		 277 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 		 278 aa  60.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  37.84 
 
 		 280 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  32.63 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  38.67 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 466 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  31.11 
 
 		 480 aa  57  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  30.23 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  35 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 		 480 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  30.23 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.3 
 
 		 393 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  27.55 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  34.44 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  34.44 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.13 
 
 		 379 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  36 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  29.03 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  34 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.21 
 
 		 566 aa  53.5  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.21 
 
 		 566 aa  53.5  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>