More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0272 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  100 
 
 
258 aa  530  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  64.78 
 
 
265 aa  344  8.999999999999999e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  45.27 
 
 
249 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  40.33 
 
 
247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  39.92 
 
 
249 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.25 
 
 
263 aa  182  7e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  40.23 
 
 
252 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 
257 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.72 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  41.56 
 
 
226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  48.67 
 
 
225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  48.31 
 
 
250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  31.75 
 
 
248 aa  113  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.03 
 
 
230 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.73 
 
 
259 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0474  hypothetical protein  29.87 
 
 
252 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.85 
 
 
255 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
226 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  33.14 
 
 
226 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  30.52 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  26.17 
 
 
244 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.76 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.12 
 
 
252 aa  92.8  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  32.34 
 
 
259 aa  92  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.38 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.99 
 
 
155 aa  90.9  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4417  methyltransferase type 11  29.39 
 
 
269 aa  89.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.587336 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1222  methyltransferase  32.53 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  26.02 
 
 
234 aa  87.8  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 
354 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
349 aa  87  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  38.51 
 
 
342 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.54 
 
 
253 aa  85.9  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.64 
 
 
253 aa  85.9  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  30.83 
 
 
262 aa  82  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2248  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.586689  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  32.56 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  44.95 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2984  methyltransferase type 11  41.23 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2026  Methyltransferase type 11  23.81 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508606  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  41.18 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  43.12 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  36.3 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  36.3 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  39.05 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  32.11 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  42 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  32.33 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  43.24 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  35 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  35.62 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  40.32 
 
 
215 aa  72  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  43.24 
 
 
251 aa  72  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.64 
 
 
296 aa  72  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  43.14 
 
 
429 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  42 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  45.36 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  34.17 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  37.98 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  34.39 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  41.9 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  35.71 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  38.19 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.68 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3028  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  34.27 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  40.82 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  39.8 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  41.82 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  35.77 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.44 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  38.98 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.62 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  36.79 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  41.12 
 
 
264 aa  68.6  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  37.72 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32 
 
 
233 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  39 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  42.73 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  29.81 
 
 
263 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.51 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.94 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  36.08 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  40.82 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0952  methyltransferase type 11  41.24 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>