More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0219 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0219  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3993  ABC transporter related  85.38 
 
 
253 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.564938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  85.38 
 
 
253 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0174  ABC transporter related  88.93 
 
 
253 aa  448  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0313265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  60.47 
 
 
265 aa  294  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  59.68 
 
 
253 aa  293  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  59.29 
 
 
253 aa  291  5e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3040  ABC transporter related  56.43 
 
 
248 aa  289  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2602  ABC transporter related  56.2 
 
 
248 aa  288  8e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  55.79 
 
 
245 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 
245 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  59.09 
 
 
244 aa  275  5e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  56.97 
 
 
243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.14 
 
 
252 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.14 
 
 
252 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.14 
 
 
252 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1918  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  57.26 
 
 
255 aa  268  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.248915  hitchhiker  0.0037294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.38 
 
 
250 aa  267  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 
244 aa  266  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  56.38 
 
 
244 aa  267  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 
244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.97 
 
 
250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.97 
 
 
250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  56.97 
 
 
250 aa  265  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.97 
 
 
250 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.97 
 
 
250 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.97 
 
 
250 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.14 
 
 
244 aa  265  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.14 
 
 
244 aa  265  7e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.97 
 
 
250 aa  265  7e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.97 
 
 
250 aa  265  7e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.14 
 
 
244 aa  265  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.97 
 
 
250 aa  265  7e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.33 
 
 
252 aa  264  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  54.73 
 
 
244 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2511  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.72 
 
 
245 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000409098  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.14 
 
 
244 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.14 
 
 
244 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  56.73 
 
 
251 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.97 
 
 
250 aa  263  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  54.13 
 
 
251 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.14 
 
 
244 aa  262  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.14 
 
 
244 aa  262  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.56 
 
 
250 aa  262  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.15 
 
 
250 aa  262  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0006  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 
245 aa  261  4.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00283619  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.87 
 
 
249 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  54.25 
 
 
248 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4922  ABC transporter related  53.06 
 
 
253 aa  260  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.85 
 
 
247 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.88 
 
 
250 aa  259  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  53.85 
 
 
248 aa  258  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  55.97 
 
 
240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.13 
 
 
244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.02 
 
 
247 aa  258  7e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002012  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  52.48 
 
 
245 aa  258  7e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000066278  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4025  ABC transporter related  54.13 
 
 
251 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4341  ABC transporter related  54.13 
 
 
251 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  54.92 
 
 
243 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00439  ABC polar amino acid transporter ATPase component  53.06 
 
 
245 aa  255  6e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3633  ABC transporter related  54.13 
 
 
263 aa  255  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3138  ABC transporter related  49.61 
 
 
253 aa  254  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.07 
 
 
253 aa  254  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.07 
 
 
253 aa  254  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  53.66 
 
 
248 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  52.85 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  54.13 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  52.48 
 
 
240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2743  ABC transporter related  53.85 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  54.96 
 
 
243 aa  252  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.48 
 
 
240 aa  251  9.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  53.53 
 
 
253 aa  250  1e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2033  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.66 
 
 
253 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 
253 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  54.29 
 
 
242 aa  249  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  52.03 
 
 
247 aa  250  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 
240 aa  249  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 
240 aa  249  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  54.96 
 
 
243 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.13 
 
 
240 aa  249  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.65 
 
 
240 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  52.61 
 
 
263 aa  249  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  53.31 
 
 
241 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3837  ABC transporter related  48.05 
 
 
253 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2910  ABC transporter related  52.46 
 
 
246 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  54.13 
 
 
239 aa  249  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 
240 aa  248  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  54.55 
 
 
240 aa  248  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  54.55 
 
 
240 aa  248  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 
240 aa  248  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 
240 aa  248  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.13 
 
 
240 aa  248  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1152  ABC transporter related  50.61 
 
 
247 aa  248  5e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.645905  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7227  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nopaline)  48.05 
 
 
253 aa  248  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.589012  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  52.87 
 
 
244 aa  248  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  50.41 
 
 
246 aa  248  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  51.65 
 
 
247 aa  248  8e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  53.06 
 
 
260 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  53.01 
 
 
256 aa  247  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.82 
 
 
267 aa  247  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>