More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0120 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0120  Cof-like hydrolase  100 
 
 
274 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0986  hypothetical protein  55.26 
 
 
273 aa  291  8e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  45.72 
 
 
273 aa  227  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  40.29 
 
 
273 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0848  phosphotransferase  41.73 
 
 
286 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  40.29 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0879  phosphotransferase  41.51 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  40.29 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0820  phosphotransferase  41.51 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0911  phosphotransferase  41.51 
 
 
286 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  41.51 
 
 
306 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  41.89 
 
 
272 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  41.51 
 
 
272 aa  198  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0934  phosphotransferase  41.13 
 
 
286 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.600795 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  41.13 
 
 
272 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2876  Cof-like hydrolase  41.35 
 
 
272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2896  phosphotransferase  41.35 
 
 
272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0306419  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0820  phosphotransferase  41.35 
 
 
272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  39.85 
 
 
272 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1306  phosphotransferase  41.41 
 
 
274 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  39.26 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  39.06 
 
 
273 aa  182  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2879  phosphotransferase  38.6 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1180  phosphotransferase  38.15 
 
 
273 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  32.95 
 
 
244 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  32.95 
 
 
244 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  32.18 
 
 
244 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  32.13 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  27.92 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  28.17 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  31 
 
 
281 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  31 
 
 
270 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  32.86 
 
 
274 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  31 
 
 
281 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  31 
 
 
270 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  26.16 
 
 
279 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  26.52 
 
 
279 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  25.99 
 
 
277 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  32.05 
 
 
270 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  31.52 
 
 
272 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  30.71 
 
 
270 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  30.71 
 
 
270 aa  105  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  30.71 
 
 
270 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  30.71 
 
 
270 aa  105  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  30.71 
 
 
270 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  30.71 
 
 
270 aa  105  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  25.63 
 
 
277 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  30.71 
 
 
270 aa  105  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  30.36 
 
 
270 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  27.9 
 
 
274 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  29.09 
 
 
273 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  30.4 
 
 
269 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  30.63 
 
 
281 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  25.55 
 
 
274 aa  99.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  30.71 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  26.64 
 
 
273 aa  97.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  27.11 
 
 
267 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  27.53 
 
 
278 aa  95.9  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  29.96 
 
 
273 aa  95.5  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0205  HAD superfamily hydrolase  27.72 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.855458  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  26.55 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  27.47 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  27.24 
 
 
268 aa  93.2  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 
262 aa  92.8  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  31.27 
 
 
281 aa  92.4  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 
265 aa  92.4  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  28.42 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  31 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  27.78 
 
 
279 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1225  HAD superfamily hydrolase  25.63 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  26.91 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1119  Cof-like hydrolase  31.79 
 
 
271 aa  90.1  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.78603  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  30.71 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  31.37 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  29.82 
 
 
268 aa  89.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  29.33 
 
 
277 aa  89  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  25.82 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  33.81 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  31.02 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.11 
 
 
273 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  28.11 
 
 
273 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  28.11 
 
 
273 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  26.32 
 
 
289 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  28.11 
 
 
273 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  28.11 
 
 
273 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  26.32 
 
 
289 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  29.2 
 
 
268 aa  86.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0900  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 
270 aa  85.9  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.183998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  28.21 
 
 
273 aa  85.9  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  31.14 
 
 
271 aa  85.5  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1851  Cof-like hydrolase  27.64 
 
 
274 aa  85.5  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  28.42 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.11 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  27.76 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.35 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  26.24 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  25.36 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  24.73 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.76 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  29.68 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>