More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0098 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  87.32 
 
 
426 aa  787    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0098  histidine kinase  100 
 
 
439 aa  905    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2122  sensor histidine kinase  38.8 
 
 
447 aa  293  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
448 aa  288  9e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.589471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0305  glycine cleavage system T protein  37.98 
 
 
448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00724107 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0779  sensor histidine kinase  35.22 
 
 
468 aa  234  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0375  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
494 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
451 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
454 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2846  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.02 
 
 
452 aa  160  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
457 aa  156  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3506  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
450 aa  152  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.996611 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.53289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
562 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4068  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1023  histidine kinase  29.18 
 
 
562 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4419  sensor histidine kinase  29.3 
 
 
431 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4824  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
446 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2860  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.7 
 
 
437 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
562 aa  142  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
562 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0867  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
555 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3688  nitrogen regulation protein NtrY, putative  27.73 
 
 
555 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4582  histidine kinase  26.32 
 
 
455 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3155  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
555 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3256  ATPase domain-containing protein  28.15 
 
 
551 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1035  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
562 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 
441 aa  137  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18234  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0326  response regulator receiver domain-containing protein  26.83 
 
 
450 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159286  normal  0.343021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5615  histidine kinase  28.03 
 
 
429 aa  136  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0017  sensor histidine kinase  30.32 
 
 
445 aa  134  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.428126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 
426 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.035298  normal  0.857551 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 
718 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0577  sensor histidine kinase  28.45 
 
 
433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122175  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
760 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
444 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 
733 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 
752 aa  126  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 
753 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4705  sensory box sensor histidine kinase  26.2 
 
 
472 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.738768  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 
769 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 
710 aa  124  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
733 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.67 
 
 
764 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2239  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 
756 aa  124  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.292158  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 
759 aa  123  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 
753 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 
729 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
768 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4526  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 
772 aa  117  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.02 
 
 
749 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  24.05 
 
 
734 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0746  sensor histidine kinase  24.94 
 
 
455 aa  114  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1443  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.49 
 
 
753 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616255  hitchhiker  0.000358642 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  23.15 
 
 
759 aa  114  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.21 
 
 
756 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1573  histidine kinase  25.06 
 
 
767 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0740881  normal  0.0763149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 
708 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.17 
 
 
757 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414611  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 
734 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  26.72 
 
 
621 aa  110  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1816  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.51 
 
 
756 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0544205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.83 
 
 
753 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 
780 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.168108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 
779 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.58 
 
 
771 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.542091  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1074  nitrogen regulation protein NtrY  23.36 
 
 
774 aa  107  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000929955  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 
744 aa  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0024  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 
736 aa  107  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.10248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0023  nitrogen regulation protein NtrY, putative  26.23 
 
 
710 aa  107  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736908  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 
736 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2607  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
747 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.515354  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1116  nitrogen regulation protein NtrY  23.06 
 
 
774 aa  106  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 
799 aa  106  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3588  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.84 
 
 
775 aa  106  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  25.4 
 
 
712 aa  106  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.99 
 
 
765 aa  106  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341187  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  30.04 
 
 
484 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 
781 aa  104  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276593  decreased coverage  0.00464659 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0593  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.95 
 
 
776 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.39 
 
 
731 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 
754 aa  104  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187529  normal  0.0210363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1617  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.92 
 
 
763 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 
740 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  31.2 
 
 
581 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
581 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  31.62 
 
 
573 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 
756 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.81 
 
 
578 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3892  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 
762 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.26 
 
 
765 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.153032 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 
779 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865325  normal  0.321459 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 
762 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235789  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.94 
 
 
655 aa  101  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1302  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
871 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465043  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2822  PAS sensor protein  23.56 
 
 
799 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.354635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 
755 aa  100  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2889  sensory transduction histidine kinase; sporulation kinase A  28.99 
 
 
801 aa  99.8  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.516791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3143  sporulation kinase  28.99 
 
 
801 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.564779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>