More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0096 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  59.41 
 
 
810 aa  939  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
813 aa  1664  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 
809 aa  487  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  33.17 
 
 
810 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  29.26 
 
 
807 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  28.57 
 
 
804 aa  344  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  27.51 
 
 
809 aa  319  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  27.85 
 
 
845 aa  319  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  30.26 
 
 
796 aa  304  5e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.43 
 
 
813 aa  291  5e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  25.52 
 
 
802 aa  283  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  30.64 
 
 
809 aa  283  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.71 
 
 
817 aa  280  7e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.08 
 
 
808 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.46 
 
 
807 aa  277  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.15 
 
 
805 aa  277  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.64 
 
 
878 aa  275  2e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  28.59 
 
 
804 aa  275  2e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.77 
 
 
807 aa  275  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  26.37 
 
 
843 aa  271  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  26.76 
 
 
805 aa  270  8e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  27.86 
 
 
808 aa  268  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  27.28 
 
 
798 aa  264  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  28.23 
 
 
821 aa  262  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  28.31 
 
 
806 aa  261  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  25.82 
 
 
797 aa  259  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.49 
 
 
809 aa  257  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  25.61 
 
 
805 aa  255  2e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.53 
 
 
805 aa  255  2e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.01 
 
 
805 aa  253  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  25.96 
 
 
803 aa  251  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.05 
 
 
823 aa  251  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  25.54 
 
 
814 aa  251  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  26.79 
 
 
869 aa  250  6e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.97 
 
 
849 aa  250  9e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  26.88 
 
 
808 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  26.79 
 
 
817 aa  246  2e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  27.01 
 
 
803 aa  244  4e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.27 
 
 
874 aa  244  4e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.56 
 
 
871 aa  244  4e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.04 
 
 
915 aa  244  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.74 
 
 
882 aa  244  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.99 
 
 
805 aa  241  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.96 
 
 
822 aa  235  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  26.15 
 
 
810 aa  235  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  26.32 
 
 
865 aa  234  7e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  28 
 
 
808 aa  232  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  28.67 
 
 
811 aa  232  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.95 
 
 
844 aa  232  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.91 
 
 
816 aa  230  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.24 
 
 
862 aa  224  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.88 
 
 
879 aa  220  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  25.7 
 
 
800 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.33 
 
 
893 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  28.47 
 
 
808 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.85 
 
 
880 aa  218  3e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  26.85 
 
 
848 aa  218  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.55 
 
 
817 aa  217  6e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  1.76456e-05 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.12 
 
 
884 aa  217  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  26.48 
 
 
831 aa  214  4e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  26.17 
 
 
835 aa  209  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.97 
 
 
883 aa  207  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  26.4 
 
 
819 aa  204  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.95 
 
 
919 aa  202  2e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  25.39 
 
 
816 aa  202  2e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  24.25 
 
 
810 aa  200  1e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.39 
 
 
913 aa  199  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.53 
 
 
888 aa  198  4e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  25.35 
 
 
887 aa  197  9e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  27.25 
 
 
803 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  25.9 
 
 
887 aa  194  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.88 
 
 
810 aa  190  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.35 
 
 
821 aa  184  4e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.94 
 
 
855 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  25.25 
 
 
861 aa  167  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  24.87 
 
 
819 aa  166  1e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.38 
 
 
828 aa  163  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.45 
 
 
812 aa  161  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  25.87 
 
 
844 aa  153  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.15 
 
 
820 aa  128  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.83 
 
 
846 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  23.78 
 
 
931 aa  122  2e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  26.92 
 
 
795 aa  119  2e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4417  putative ABC transporter, permease protein  22.97 
 
 
830 aa  110  8e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.56334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  25.17 
 
 
806 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4858  protein of unknown function DUF214  25.31 
 
 
809 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0512952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1804  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 
802 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 
797 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4621  protein of unknown function DUF214  24.55 
 
 
791 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  25.77 
 
 
811 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  23.94 
 
 
804 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  23.78 
 
 
795 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  22.57 
 
 
805 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  24.87 
 
 
777 aa  105  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4850  protein of unknown function DUF214  24.13 
 
 
791 aa  104  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0898255  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  25.27 
 
 
808 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  22.5 
 
 
790 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  24.14 
 
 
794 aa  101  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  25.51 
 
 
793 aa  99.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  25.67 
 
 
794 aa  97.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>