More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0095 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  100 
 
 
235 aa  483  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  93.19 
 
 
235 aa  450  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  64.73 
 
 
237 aa  325  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2119  ABC transporter, ATP-binding protein  69.96 
 
 
241 aa  323  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  64.66 
 
 
240 aa  318  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  66.22 
 
 
234 aa  303  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0775  ABC transporter, ATP-binding protein  61.4 
 
 
243 aa  286  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  55.2 
 
 
220 aa  255  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  54.05 
 
 
225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  55.25 
 
 
263 aa  252  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  55.45 
 
 
220 aa  252  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
230 aa  251  9.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  53.15 
 
 
225 aa  251  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  54.34 
 
 
246 aa  250  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  54.34 
 
 
246 aa  250  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  54.34 
 
 
246 aa  250  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  52.7 
 
 
226 aa  249  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  54.34 
 
 
230 aa  249  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 
244 aa  248  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  54.34 
 
 
253 aa  248  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  53.42 
 
 
246 aa  248  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  53.42 
 
 
243 aa  248  7e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  53.42 
 
 
246 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 
246 aa  248  9e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  53.42 
 
 
247 aa  247  9e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  53.42 
 
 
247 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  53.42 
 
 
247 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  52.36 
 
 
240 aa  245  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  52.51 
 
 
253 aa  244  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  53.42 
 
 
232 aa  244  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  51.75 
 
 
229 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  52.97 
 
 
219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  51.6 
 
 
241 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  52.05 
 
 
240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  50.9 
 
 
242 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  49.12 
 
 
233 aa  240  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  50 
 
 
225 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  51.6 
 
 
247 aa  237  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  46.85 
 
 
237 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4175  ABC transporter related  47.3 
 
 
237 aa  236  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2600  ABC transporter related  54.75 
 
 
227 aa  235  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  50.22 
 
 
236 aa  234  7e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  50.88 
 
 
238 aa  233  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  49.1 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  51.09 
 
 
235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  49.33 
 
 
230 aa  231  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
232 aa  231  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  47.37 
 
 
260 aa  231  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.09 
 
 
246 aa  231  8.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  48.09 
 
 
237 aa  229  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  50.44 
 
 
241 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  50.44 
 
 
241 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  48.93 
 
 
233 aa  229  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  50 
 
 
241 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  47.35 
 
 
253 aa  228  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.2 
 
 
258 aa  228  7e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 
238 aa  226  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  48.65 
 
 
225 aa  226  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  48.66 
 
 
224 aa  225  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  50.23 
 
 
228 aa  225  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  51.96 
 
 
248 aa  225  4e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0384  ABC transporter related protein  47.14 
 
 
237 aa  225  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0282  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
223 aa  224  8e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  48.21 
 
 
239 aa  224  9e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  48.88 
 
 
226 aa  224  9e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  48.09 
 
 
238 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 
253 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  49.1 
 
 
291 aa  223  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.1 
 
 
647 aa  223  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.39 
 
 
242 aa  223  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
236 aa  223  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  46.35 
 
 
252 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.32 
 
 
230 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  49.11 
 
 
253 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  49.55 
 
 
229 aa  222  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  47.75 
 
 
232 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  46.93 
 
 
228 aa  222  4e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  49.55 
 
 
229 aa  221  6e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  47.3 
 
 
226 aa  221  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  50.45 
 
 
256 aa  220  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  47.11 
 
 
657 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  47.19 
 
 
248 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  45.02 
 
 
244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  47.09 
 
 
678 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  47.09 
 
 
678 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 
226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.09 
 
 
678 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  45.58 
 
 
248 aa  219  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 
226 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  48.64 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  48.64 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  48.68 
 
 
239 aa  218  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  46.67 
 
 
241 aa  218  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 
226 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  47.75 
 
 
226 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  47.27 
 
 
228 aa  218  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 
226 aa  217  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 
226 aa  217  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  49.77 
 
 
241 aa  217  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  50.9 
 
 
291 aa  217  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>