89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0093 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  674  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  70.37 
 
 
363 aa  468  1e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  28.52 
 
 
288 aa  117  2e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  31.2 
 
 
285 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  28.09 
 
 
288 aa  95.5  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  32.76 
 
 
343 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  31.88 
 
 
277 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  30.38 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  31.56 
 
 
322 aa  89.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  26.51 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  33.33 
 
 
296 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  31.15 
 
 
295 aa  85.9  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  23.3 
 
 
308 aa  84.7  2e-15  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  1.37217e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  32.17 
 
 
277 aa  83.6  4e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  30.04 
 
 
279 aa  83.6  5e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  31.09 
 
 
300 aa  83.2  6e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  30.86 
 
 
292 aa  82.4  1e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  30.55 
 
 
294 aa  82  1e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  29.25 
 
 
301 aa  81.6  2e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  30.48 
 
 
293 aa  80.9  3e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  28.77 
 
 
305 aa  79.3  8e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  31.85 
 
 
285 aa  79.3  8e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  31.11 
 
 
320 aa  77.8  2e-13  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  30.74 
 
 
320 aa  77  4e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  32.21 
 
 
295 aa  76.6  5e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  25.3 
 
 
277 aa  76.3  7e-13  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  31.45 
 
 
285 aa  75.1  2e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  27.73 
 
 
287 aa  74.7  2e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  29.74 
 
 
326 aa  70.9  3e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2593  hypothetical protein  22.46 
 
 
288 aa  69.3  8e-11  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2720  hypothetical protein  22.65 
 
 
288 aa  68.6  1e-10  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  27.4 
 
 
326 aa  68.6  2e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  35.16 
 
 
305 aa  67.4  4e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  28.16 
 
 
308 aa  63.5  5e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  30.24 
 
 
302 aa  62.8  9e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  28.44 
 
 
277 aa  61.6  2e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  32.71 
 
 
326 aa  58.5  2e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  27.78 
 
 
285 aa  56.6  6e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  27.69 
 
 
284 aa  56.2  8e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 
311 aa  55.5  1e-06  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  21.78 
 
 
285 aa  55.5  1e-06  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2192  alpha/beta hydrolase fold protein  38.16 
 
 
248 aa  52.4  1e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  9.41808e-08  hitchhiker  0.00021747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
258 aa  50.4  4e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
289 aa  50.1  5e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  30.21 
 
 
294 aa  49.3  8e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.31 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  31.1 
 
 
289 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  30.81 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  30.57 
 
 
280 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  30.57 
 
 
280 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  30.57 
 
 
303 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  30.57 
 
 
303 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0930  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
353 aa  48.5  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.262711  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02220  hypothetical protein  29.33 
 
 
151 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  38.37 
 
 
250 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
277 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1696  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  32.76 
 
 
307 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
254 aa  47  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  29.3 
 
 
303 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  33.2 
 
 
323 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  30.07 
 
 
303 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 
289 aa  46.2  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  30.07 
 
 
303 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  28.65 
 
 
294 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5393  hypothetical protein  30.85 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2319  hypothetical protein  36.51 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.201486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5299  hypothetical protein  34.33 
 
 
356 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  26.7 
 
 
323 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  30.83 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 
298 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0401  hypothetical protein  35.53 
 
 
313 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  30.81 
 
 
296 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  25.4 
 
 
309 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1860  Alpha/beta hydrolase  33.68 
 
 
329 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.0180917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  28.8 
 
 
322 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5214  lipase  34.43 
 
 
308 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 
320 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3155  alpha/beta hydrolase  32.99 
 
 
332 aa  43.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.200614  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0536  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.95 
 
 
398 aa  42.7  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13712  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  24.88 
 
 
314 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 
292 aa  42.7  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  32.74 
 
 
296 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  33.8 
 
 
283 aa  42.4  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  27.27 
 
 
331 aa  42.7  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1877  Epoxide hydrolase domain protein  24.14 
 
 
361 aa  42.4  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>