More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0065 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  100 
 
 
373 aa  744  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  42.56 
 
 
332 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  35.31 
 
 
393 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  35.94 
 
 
393 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  33.86 
 
 
396 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  34.3 
 
 
393 aa  156  5e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  35.48 
 
 
403 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  33.33 
 
 
399 aa  134  4e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  34.55 
 
 
420 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29.6 
 
 
315 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  30.32 
 
 
404 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29.6 
 
 
315 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  32.09 
 
 
391 aa  120  5e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  29.91 
 
 
320 aa  119  1e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  31 
 
 
400 aa  119  1e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  30.77 
 
 
298 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  32.08 
 
 
315 aa  115  9e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  30.82 
 
 
399 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  29.52 
 
 
321 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  32.11 
 
 
302 aa  112  1e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  29.07 
 
 
323 aa  111  2e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  32.29 
 
 
318 aa  110  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  26.18 
 
 
317 aa  108  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  29.39 
 
 
321 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  28.43 
 
 
313 aa  106  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  32.03 
 
 
302 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  29.36 
 
 
391 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  29.57 
 
 
303 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  30.57 
 
 
317 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  31.23 
 
 
322 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  28.12 
 
 
395 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  27.03 
 
 
396 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  32.2 
 
 
303 aa  102  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  1.16273e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  27.16 
 
 
312 aa  102  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  24.51 
 
 
408 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  8.7715e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  31.4 
 
 
328 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.14155e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  27.88 
 
 
391 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  26.98 
 
 
332 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  27.97 
 
 
318 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  25.5 
 
 
387 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  30.13 
 
 
313 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  29.45 
 
 
311 aa  99.8  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  28.14 
 
 
292 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  32.57 
 
 
306 aa  99.4  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  31.67 
 
 
297 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  28.98 
 
 
315 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  29.96 
 
 
321 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  31.96 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  26.02 
 
 
316 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  28.57 
 
 
301 aa  98.2  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  27.76 
 
 
292 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  29.23 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  29.14 
 
 
304 aa  97.1  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  27.24 
 
 
292 aa  97.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  29.97 
 
 
297 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  29.97 
 
 
297 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  26.98 
 
 
317 aa  96.7  6e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  30.5 
 
 
336 aa  96.7  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  27.95 
 
 
292 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  28.47 
 
 
300 aa  96.3  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  27.95 
 
 
292 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  29.17 
 
 
313 aa  96.3  8e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0678  ROK family protein  27.21 
 
 
324 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0268502  hitchhiker  0.00659197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  27.24 
 
 
400 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  30.7 
 
 
327 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  30.7 
 
 
327 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  29.06 
 
 
292 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  30.5 
 
 
334 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  26.71 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  27.24 
 
 
384 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  27.21 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  27.95 
 
 
292 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  30.58 
 
 
336 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3048  ROK family protein  28.71 
 
 
323 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  32.36 
 
 
403 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  30.28 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  25.7 
 
 
414 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  28.67 
 
 
393 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27.34 
 
 
406 aa  93.6  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  25.51 
 
 
292 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  26.4 
 
 
314 aa  93.2  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  27.69 
 
 
417 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  30.38 
 
 
327 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  30.38 
 
 
327 aa  92.8  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  30.38 
 
 
327 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  30.38 
 
 
327 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  30.38 
 
 
327 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  30.38 
 
 
327 aa  92.8  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  30.38 
 
 
327 aa  92.8  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03956  D-allose kinase  30.45 
 
 
309 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.689878  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03916  hypothetical protein  30.45 
 
 
309 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0706  putative glucokinase  24.84 
 
 
311 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.660435  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3942  D-allose kinase  30.45 
 
 
309 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  29.48 
 
 
401 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3907  ROK familiy protein  30.45 
 
 
309 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.51 
 
 
395 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  28.94 
 
 
392 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  29.34 
 
 
332 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  25.64 
 
 
389 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  32.17 
 
 
312 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>