253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0058 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 		 212 aa  446  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4452  DNA-3-methyladenine glycosylase I  83.33 
 
 		 187 aa  342  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.748727  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4170  DNA-3-methyladenine glycosylase I  82.8 
 
 		 187 aa  337  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  80.65 
 
 		 186 aa  327  8e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  69.06 
 
 		 187 aa  285  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  69.06 
 
 		 187 aa  285  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  69.06 
 
 		 187 aa  285  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  69.06 
 
 		 187 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  70.56 
 
 		 187 aa  283  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  68.51 
 
 		 187 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  68.51 
 
 		 187 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  68.51 
 
 		 187 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  66.3 
 
 		 193 aa  281  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  68.51 
 
 		 187 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  67.96 
 
 		 187 aa  280  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  66.3 
 
 		 193 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.696634 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  66.3 
 
 		 193 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  68.45 
 
 		 190 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3785  DNA-3-methyladenine glycosylase  68.45 
 
 		 190 aa  279  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  65.75 
 
 		 193 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  65.75 
 
 		 193 aa  278  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0021  DNA-3-methyladenine glycosylase I  68.45 
 
 		 190 aa  278  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092391  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0175  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  67.4 
 
 		 193 aa  278  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.66 
 
 		 190 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.07 
 
 		 187 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00154604  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.66 
 
 		 196 aa  229  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.84 
 
 		 189 aa  229  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.35 
 
 		 196 aa  228  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.75 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.91 
 
 		 186 aa  224  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0016  DNA-3-methyladenine glycosidase I  55.37 
 
 		 191 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.24 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602981 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.24 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.25 
 
 		 198 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0018  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.24 
 
 		 191 aa  219  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000168083 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.04 
 
 		 204 aa  218  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.49 
 
 		 200 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.91 
 
 		 194 aa  218  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000247076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.93 
 
 		 198 aa  217  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.01 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.01 
 
 		 198 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.93 
 
 		 200 aa  215  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.93 
 
 		 200 aa  215  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.89 
 
 		 191 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00010  constitutive 3-methyl-adenine DNA glycosylase I  51.35 
 
 		 202 aa  214  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.51 
 
 		 194 aa  214  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.15 
 
 		 190 aa  214  9e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0027  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.41 
 
 		 189 aa  214  9e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.87 
 
 		 192 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.78 
 
 		 186 aa  212  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0008  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.04 
 
 		 187 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.37 
 
 		 204 aa  212  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.99 
 
 		 212 aa  212  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.35 
 
 		 202 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.14 
 
 		 198 aa  211  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.72 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.4 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.37 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.43 
 
 		 202 aa  208  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.96 
 
 		 199 aa  208  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.33 
 
 		 186 aa  207  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.27 
 
 		 208 aa  207  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  54.49 
 
 		 189 aa  207  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.44 
 
 		 220 aa  207  9e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 		 190 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.04 
 
 		 194 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 		 218 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.61 
 
 		 191 aa  204  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.63 
 
 		 210 aa  204  9e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.75 
 
 		 187 aa  204  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.27 
 
 		 196 aa  203  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2464  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.67 
 
 		 192 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.65 
 
 		 195 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.4 
 
 		 208 aa  202  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0570  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.44 
 
 		 183 aa  202  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.890211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0062  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.07 
 
 		 183 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000318334 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.3 
 
 		 198 aa  201  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 		 209 aa  201  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.96 
 
 		 188 aa  201  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0078  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.07 
 
 		 183 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0348853  normal  0.0800012 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  51.1 
 
 		 189 aa  200  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.72 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.46 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.96 
 
 		 194 aa  198  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.34 
 
 		 208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0081  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.96 
 
 		 183 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462301  hitchhiker  0.000000000590719 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.15 
 
 		 191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 		 188 aa  198  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 		 188 aa  198  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  51.11 
 
 		 190 aa  197  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.46 
 
 		 217 aa  197  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0057  methyladenine glycosylase  51.37 
 
 		 196 aa  197  7e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.48 
 
 		 223 aa  197  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0672  hypothetical protein  49.72 
 
 		 190 aa  197  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.09 
 
 		 191 aa  197  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0078  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.96 
 
 		 183 aa  197  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0674727  hitchhiker  0.0000000000856753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.42 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1277  DNA-3-methyladenine glycosidase I  51.7 
 
 		 193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0656  hypothetical protein  49.72 
 
 		 190 aa  195  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.37 
 
 		 193 aa  194  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>