More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0049 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
350 aa  713    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  59.37 
 
 
350 aa  431  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  59.43 
 
 
350 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  56.13 
 
 
350 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.41 
 
 
350 aa  395  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  56.13 
 
 
350 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  56.41 
 
 
350 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  56.41 
 
 
350 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  56.13 
 
 
350 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  56.13 
 
 
350 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  56.41 
 
 
350 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  56.13 
 
 
350 aa  396  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  56.41 
 
 
350 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60 
 
 
350 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  45.35 
 
 
373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  45.33 
 
 
373 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2032  sorbitol dehydrogenase, putative  47.71 
 
 
350 aa  298  1e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000906358  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  43.94 
 
 
373 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.94 
 
 
373 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  43.94 
 
 
373 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.1 
 
 
373 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  42.86 
 
 
352 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  44.03 
 
 
354 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.03 
 
 
354 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  44.03 
 
 
365 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0357  zinc-dependent dehydrogenase  45.4 
 
 
349 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.18 
 
 
354 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
354 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  44.79 
 
 
373 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  42.61 
 
 
362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  41.76 
 
 
360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  42.98 
 
 
352 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  44.57 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  42.33 
 
 
354 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  42.33 
 
 
362 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  43.87 
 
 
349 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  41.76 
 
 
362 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  42.05 
 
 
363 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  42.65 
 
 
364 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  42.33 
 
 
363 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  43.3 
 
 
350 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.31 
 
 
351 aa  268  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  47.03 
 
 
351 aa  267  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2959  alcohol dehydrogenase  44.19 
 
 
373 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0912  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  41.93 
 
 
349 aa  262  8e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00151014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  41.81 
 
 
353 aa  258  8e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00599  conserved hypothetical protein  39.66 
 
 
369 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.932146  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.46 
 
 
356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0784  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.76 
 
 
353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07590  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  43.63 
 
 
357 aa  252  8.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  39.94 
 
 
355 aa  251  9.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2380  alcohol dehydrogenase  44.63 
 
 
354 aa  251  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.209062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2069  alcohol dehydrogenase  43.91 
 
 
352 aa  245  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  38.97 
 
 
340 aa  236  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.22 
 
 
358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00723934  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  38.4 
 
 
340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  37.54 
 
 
340 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 
357 aa  229  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.11 
 
 
340 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7649  zinc-binding dehydrogenase  37.6 
 
 
357 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4040  alcohol dehydrogenase  40.11 
 
 
356 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0364126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 
341 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 
341 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 
341 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 
341 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 
341 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 
341 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  38.81 
 
 
341 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 
341 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09288  conserved hypothetical protein  36.07 
 
 
382 aa  219  7.999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2217  alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 
357 aa  216  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0556  alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 
343 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.46957  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0638  alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 
343 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1668  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 
343 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1692  alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 
343 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1641  alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 
343 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0527  alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 
343 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361888  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5456  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.68 
 
 
343 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.077084  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5853  alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 
343 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00833857  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2976  alcohol dehydrogenase  37.18 
 
 
358 aa  200  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4034  alcohol dehydrogenase  36.9 
 
 
357 aa  198  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89701  polyol dehydrogenase  35.62 
 
 
385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0745  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  32.87 
 
 
360 aa  188  1e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3841  alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 
350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.506956 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  33.9 
 
 
338 aa  182  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3580  hypothetical protein  34.02 
 
 
350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.885973 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74116  Sorbitol dehydrogenase  33.33 
 
 
378 aa  180  4e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.145167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.39 
 
 
366 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.74 
 
 
346 aa  170  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.73 
 
 
336 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.3 
 
 
347 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270529  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5833  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
347 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119386  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.85 
 
 
347 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.42 
 
 
343 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4579  alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 
373 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.69 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.01 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  32.11 
 
 
375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  31.25 
 
 
342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1874  GroES-related  32.57 
 
 
335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>