More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0041 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
203 aa  404  1e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  51.72 
 
 
203 aa  184  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  47.29 
 
 
203 aa  183  1e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  49.26 
 
 
205 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  49.76 
 
 
204 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238287  normal  0.209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.01 
 
 
203 aa  178  5e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.45744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0887  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.8 
 
 
205 aa  174  1e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.04 
 
 
204 aa  171  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  46.77 
 
 
202 aa  171  6e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2195  lysine exporter protein LysE/YggA  49.75 
 
 
220 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.77 
 
 
203 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4190  Rht family transporter amino acid efflux protein  49.48 
 
 
203 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  0.194107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3213  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.53 
 
 
204 aa  166  3e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2814  lysine exporter protein LysE/YggA  47.06 
 
 
204 aa  162  4e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0715917  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  41.46 
 
 
205 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1545  amino acid transporter LysE  45 
 
 
204 aa  158  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0680  amino acid transporter LysE  44.83 
 
 
207 aa  157  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199989  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1052  lysine exporter protein LysE/YggA  46.15 
 
 
203 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0187  amino-acid exporter protein  44.78 
 
 
204 aa  151  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2570  lysine exporter protein LysE/YggA  43.09 
 
 
205 aa  144  7e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00200022  unclonable  4.06824e-08 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0505  lysine exporter protein LysE/YggA  41.29 
 
 
210 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1665  RhtB family transporter  41.41 
 
 
202 aa  121  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0298  lysine exporter protein LysE/YggA  41.41 
 
 
202 aa  120  2e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  34 
 
 
206 aa  113  2e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33 
 
 
208 aa  108  4e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  38.5 
 
 
204 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  38.5 
 
 
204 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  38.5 
 
 
204 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 
206 aa  105  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  33.17 
 
 
208 aa  104  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 
208 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 
208 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  34.98 
 
 
209 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  37.5 
 
 
204 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 
208 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
203 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  40.35 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  40.35 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  40.35 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  40.35 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.96 
 
 
208 aa  99  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.5 
 
 
205 aa  98.6  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.16 
 
 
207 aa  98.2  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  3.97574e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.85 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
204 aa  94.4  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  30.46 
 
 
205 aa  94  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.62 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.84 
 
 
232 aa  92.8  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.14 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  5.49104e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  31.53 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  32.38 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
204 aa  92.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3911  putative amino acid (threonine) efflux protein  35.78 
 
 
208 aa  92  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856049  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.73 
 
 
206 aa  91.3  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  30.2 
 
 
210 aa  90.5  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.95 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 
204 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0023  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 
209 aa  89.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  32.38 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 
227 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
217 aa  89.4  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  31.72 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.03 
 
 
205 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.85 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  30.15 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 
204 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.07 
 
 
207 aa  88.2  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.55 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.12 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  34 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  39.74 
 
 
211 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.84 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.71 
 
 
211 aa  85.5  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  30.5 
 
 
210 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.94 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.16 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.94 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.94 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  33.94 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  33.94 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.94 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.94 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  33.94 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.94 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 
208 aa  85.1  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.1 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  30.69 
 
 
213 aa  84.7  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0885  lysine exporter protein LysE/YggA  33.97 
 
 
218 aa  84.7  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347055  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.53 
 
 
208 aa  84.7  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.33 
 
 
206 aa  84.7  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.16 
 
 
210 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.25 
 
 
209 aa  84.3  1e-15  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  34.67 
 
 
209 aa  84  1e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>