101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0032 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 341 aa  708    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  92.67 
 
 		 341 aa  645    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  83.43 
 
 		 344 aa  592  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  82.27 
 
 		 344 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  68.37 
 
 		 345 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  68.37 
 
 		 345 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  62.46 
 
 		 354 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  57.06 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  51.17 
 
 		 342 aa  346  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  64 
 
 		 256 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  50.48 
 
 		 352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  52.46 
 
 		 338 aa  322  6e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  50.77 
 
 		 365 aa  317  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  49.03 
 
 		 336 aa  312  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  50.65 
 
 		 342 aa  311  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  47.92 
 
 		 344 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  49.85 
 
 		 350 aa  309  5e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  48.75 
 
 		 366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  49.03 
 
 		 352 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  46.41 
 
 		 353 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  43.28 
 
 		 334 aa  300  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  43.95 
 
 		 333 aa  298  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  45.77 
 
 		 334 aa  298  8e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  45.99 
 
 		 335 aa  297  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  45.23 
 
 		 353 aa  295  6e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  41.72 
 
 		 333 aa  295  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  44.94 
 
 		 336 aa  295  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  44.85 
 
 		 343 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  47.04 
 
 		 335 aa  293  3e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  44.14 
 
 		 352 aa  293  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  44.79 
 
 		 339 aa  292  5e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  46.93 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  44.62 
 
 		 352 aa  290  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  43.21 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  45.86 
 
 		 359 aa  290  2e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  44.62 
 
 		 353 aa  290  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  46.2 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  44.19 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  44.03 
 
 		 340 aa  286  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  43.77 
 
 		 342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  43.75 
 
 		 355 aa  281  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  43.75 
 
 		 355 aa  281  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  45.51 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  43.51 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  48.2 
 
 		 281 aa  276  4e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  44.48 
 
 		 331 aa  276  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  42.58 
 
 		 345 aa  275  6e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  42.95 
 
 		 358 aa  269  4e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  44.12 
 
 		 356 aa  268  7e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  43.96 
 
 		 369 aa  267  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  40.88 
 
 		 342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  40.82 
 
 		 342 aa  264  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  41.94 
 
 		 357 aa  263  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  40.78 
 
 		 342 aa  259  6e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  40.94 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  42.07 
 
 		 350 aa  246  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  38.51 
 
 		 361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  47.01 
 
 		 242 aa  211  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  31.17 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  46.28 
 
 		 197 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  46.28 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  44.92 
 
 		 332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  48.33 
 
 		 192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  47.11 
 
 		 329 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  48.72 
 
 		 126 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  46.28 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  37.3 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  37.3 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  42.98 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  49.14 
 
 		 127 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  44.63 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  43.8 
 
 		 141 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  39.84 
 
 		 291 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  33.73 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  37.9 
 
 		 337 aa  102  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  38.14 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  34.65 
 
 		 334 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  33.06 
 
 		 210 aa  95.9  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  36.07 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  36.07 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  94.4  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  36.29 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  33.33 
 
 		 198 aa  89  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  36.75 
 
 		 144 aa  86.7  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  47.62 
 
 		 164 aa  86.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  46.91 
 
 		 90 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  39.18 
 
 		 121 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  31.62 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  40.28 
 
 		 108 aa  70.5  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1274  virulence protein-like protein  37.11 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  45.45 
 
 		 55 aa  56.6  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4013  hypothetical protein  59.26 
 
 		 48 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03541  conserved hypothetical protein  56.36 
 
 		 49 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0047  conserved hypothetical protein  57.41 
 
 		 48 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3870  hypothetical protein  56.36 
 
 		 49 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  32.84 
 
 		 105 aa  53.9  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  31.08 
 
 		 81 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3008  hypothetical protein  29.73 
 
 		 77 aa  47  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2024  hypothetical protein  36.21 
 
 		 88 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.454055 
 
 
-
 
NC_002950  PG0821  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 120 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>