More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0031 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2311  extracellular solute-binding protein family 5  61.97 
 
 
562 aa  680  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34367  normal  0.0804809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1057  extracellular solute-binding protein  75.83 
 
 
557 aa  815  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3157  extracellular solute-binding protein  70.28 
 
 
541 aa  771  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0031  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
547 aa  1114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4174  extracellular solute-binding protein family 5  84.16 
 
 
545 aa  921  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0033  extracellular solute-binding protein family 5  87.57 
 
 
547 aa  947  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7175  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  68.79 
 
 
543 aa  759  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4854  putative ABC transporter (substrate binding protein)  69.98 
 
 
554 aa  758  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4456  extracellular solute-binding protein family 5  83.46 
 
 
545 aa  906  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2749  extracellular solute-binding protein family 5  52.51 
 
 
550 aa  520  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.954537  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05550  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  49.71 
 
 
550 aa  490  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.163393  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2659  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 
535 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696058  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5184  ABC-type transporter, substrate binding protein  33.91 
 
 
550 aa  266  9e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4832  putative ABC transporter (substrate binding protein)  34.11 
 
 
551 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264059  normal  0.92248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4320  extracellular solute-binding protein family 5  33.83 
 
 
554 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.74 
 
 
542 aa  256  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256824  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34340  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.3 
 
 
562 aa  249  8e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144528  normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1779  extracellular solute-binding protein family 5  33.52 
 
 
547 aa  243  9e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79401e-13 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0939  extracellular solute-binding protein family 5  34.3 
 
 
532 aa  239  7e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  33.72 
 
 
554 aa  226  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0295  extracellular solute-binding protein family 5  32.71 
 
 
558 aa  223  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4820  extracellular solute-binding protein  30.78 
 
 
556 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18670  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 
587 aa  215  2e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3755  extracellular solute-binding protein  32.13 
 
 
557 aa  214  3e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3088  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein, putative  31.35 
 
 
542 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2530  putative ABC transporter  30.62 
 
 
553 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  30.51 
 
 
537 aa  203  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  31.12 
 
 
542 aa  203  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2958  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 
543 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  31.26 
 
 
541 aa  200  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2115  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 
511 aa  199  8e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435863  normal  0.188347 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 
555 aa  199  1e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  30.83 
 
 
537 aa  198  2e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 
546 aa  198  2e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3223  ABC transporter, periplasmic binding protein  32.33 
 
 
539 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680403  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  31.47 
 
 
535 aa  193  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 
546 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 
546 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  31.06 
 
 
546 aa  190  6e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  29.74 
 
 
560 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3498  extracellular solute-binding protein family 5  28.25 
 
 
560 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.716688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.27 
 
 
550 aa  178  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  27.89 
 
 
551 aa  177  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2173  extracellular solute-binding protein family 5  27.11 
 
 
544 aa  157  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0241  extracellular solute-binding protein family 5  27.07 
 
 
551 aa  155  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.161576  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24440  extracellular solute-binding protein  30.75 
 
 
601 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.63 
 
 
534 aa  147  4e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.54 
 
 
535 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6076  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.39 
 
 
524 aa  142  1e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814144  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 
527 aa  143  1e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  27.47 
 
 
526 aa  135  2e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.47 
 
 
526 aa  135  2e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2402  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.12 
 
 
538 aa  134  4e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
564 aa  132  1e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25.76 
 
 
541 aa  132  2e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  6.66118e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
575 aa  128  2e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.61 
 
 
525 aa  127  4e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  30.54 
 
 
553 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
536 aa  126  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  25.74 
 
 
530 aa  124  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
520 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.8 
 
 
512 aa  124  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.52 
 
 
575 aa  122  1e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 
508 aa  123  1e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  26.52 
 
 
575 aa  122  1e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 
505 aa  122  2e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  26.68 
 
 
515 aa  122  2e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  27.4 
 
 
566 aa  122  2e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.22 
 
 
520 aa  122  2e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  27.72 
 
 
520 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.61 
 
 
512 aa  121  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 
518 aa  121  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
530 aa  121  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.61 
 
 
512 aa  121  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
512 aa  121  4e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1771  extracellular solute-binding protein family 5  29.09 
 
 
547 aa  121  4e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.38 
 
 
512 aa  121  4e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  25.8 
 
 
520 aa  120  5e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
512 aa  120  5e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 
512 aa  120  5e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  25.38 
 
 
512 aa  120  5e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.67 
 
 
567 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  25.57 
 
 
493 aa  120  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.61 
 
 
512 aa  120  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  26.24 
 
 
575 aa  120  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
520 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.43 
 
 
575 aa  120  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
520 aa  120  8e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
520 aa  120  8e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
520 aa  119  1e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  25.73 
 
 
517 aa  119  1e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  22.7 
 
 
521 aa  119  2e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  25.97 
 
 
575 aa  118  2e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.62 
 
 
575 aa  118  2e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.82 
 
 
555 aa  119  2e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  26.57 
 
 
513 aa  118  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  22.7 
 
 
521 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 
521 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  27.56 
 
 
517 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.7 
 
 
521 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>