More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0028 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  100 
 
 
546 aa  1078  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  80.26 
 
 
561 aa  845  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.42 
 
 
546 aa  670  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  67.89 
 
 
557 aa  692  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  78.23 
 
 
565 aa  822  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  66.36 
 
 
563 aa  659  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  82.63 
 
 
558 aa  865  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  63.57 
 
 
547 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  56.64 
 
 
583 aa  543  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  54.86 
 
 
575 aa  536  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  55.87 
 
 
536 aa  534  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  49.11 
 
 
594 aa  521  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  49.55 
 
 
571 aa  518  1e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  49.55 
 
 
573 aa  516  1e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  53.39 
 
 
551 aa  516  1e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  50.8 
 
 
573 aa  511  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  53.44 
 
 
661 aa  510  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  48.79 
 
 
541 aa  494  1e-138  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.27 
 
 
643 aa  488  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  50.47 
 
 
539 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  49.31 
 
 
619 aa  481  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.82 
 
 
584 aa  481  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  50.27 
 
 
565 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  48.47 
 
 
597 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.73334e-12 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  47.05 
 
 
588 aa  478  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.37 
 
 
548 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  48.31 
 
 
597 aa  475  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  51.33 
 
 
547 aa  467  1e-130  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.79 
 
 
572 aa  466  1e-130  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  49.81 
 
 
548 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  50.09 
 
 
542 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.77 
 
 
578 aa  454  1e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  43.24 
 
 
606 aa  454  1e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  46.54 
 
 
600 aa  455  1e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4323  ABC transporter related  48.03 
 
 
547 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  48.79 
 
 
545 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  43.88 
 
 
609 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  45.11 
 
 
592 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  42.7 
 
 
615 aa  439  1e-122  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.87 
 
 
564 aa  441  1e-122  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  42.7 
 
 
612 aa  442  1e-122  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  43.41 
 
 
562 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  45.92 
 
 
606 aa  437  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  43.41 
 
 
549 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  44.06 
 
 
586 aa  438  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44 
 
 
619 aa  438  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  48.11 
 
 
538 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.8 
 
 
617 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  44.63 
 
 
554 aa  436  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  46.18 
 
 
541 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 
540 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  43.43 
 
 
640 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  41.65 
 
 
609 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  46.36 
 
 
550 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  47.46 
 
 
534 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  41.28 
 
 
601 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  43.98 
 
 
592 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  43.4 
 
 
593 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  44.17 
 
 
592 aa  435  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  45.28 
 
 
552 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  42.56 
 
 
640 aa  432  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  45.08 
 
 
576 aa  429  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  42.83 
 
 
623 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  39.19 
 
 
629 aa  430  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  43.29 
 
 
619 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  41.72 
 
 
583 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.53 
 
 
611 aa  425  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  42.91 
 
 
571 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  42.65 
 
 
623 aa  427  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  42.65 
 
 
623 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  42.83 
 
 
629 aa  428  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.71 
 
 
626 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  42.83 
 
 
623 aa  428  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  44.65 
 
 
550 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  42.65 
 
 
623 aa  427  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  42.44 
 
 
588 aa  428  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  44.05 
 
 
549 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.26 
 
 
632 aa  428  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  45.2 
 
 
557 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  42.65 
 
 
623 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  45.31 
 
 
603 aa  422  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.65 
 
 
590 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  42.54 
 
 
522 aa  425  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  44.17 
 
 
625 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.47 
 
 
612 aa  425  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  41.87 
 
 
617 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  41.03 
 
 
593 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  44.74 
 
 
553 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  41.81 
 
 
623 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  42.47 
 
 
612 aa  425  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  44.47 
 
 
552 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  42.7 
 
 
545 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.45 
 
 
548 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  39.64 
 
 
627 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  42.1 
 
 
599 aa  422  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  44.76 
 
 
544 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  43.53 
 
 
566 aa  421  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.96 
 
 
534 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  41.64 
 
 
623 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  42.88 
 
 
564 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>