More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0027 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
345 aa  687    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  88.08 
 
 
346 aa  606  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  79.3 
 
 
344 aa  531  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  79.01 
 
 
344 aa  527  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  68.47 
 
 
348 aa  441  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  66.67 
 
 
348 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  64.55 
 
 
347 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  64.67 
 
 
376 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  60.55 
 
 
341 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  57.57 
 
 
343 aa  355  6.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  57.19 
 
 
372 aa  322  5e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  51.63 
 
 
405 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  30.45 
 
 
342 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  28.39 
 
 
341 aa  114  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  35.11 
 
 
364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  32.77 
 
 
341 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  32.92 
 
 
327 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.44 
 
 
354 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  34.01 
 
 
338 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  31.14 
 
 
363 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  31.39 
 
 
344 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  32.63 
 
 
355 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  32.56 
 
 
341 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  31.78 
 
 
341 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  30.92 
 
 
361 aa  102  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  30.09 
 
 
359 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  34.63 
 
 
381 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  41.43 
 
 
362 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  30.24 
 
 
346 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  29.66 
 
 
345 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  28.12 
 
 
347 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  30.61 
 
 
372 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
329 aa  99.4  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  28.73 
 
 
346 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  30 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  28.41 
 
 
346 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  35.26 
 
 
364 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  28.41 
 
 
346 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  31.09 
 
 
345 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  30.7 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  28.61 
 
 
345 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  32.33 
 
 
377 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  30.56 
 
 
356 aa  96.7  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  30.45 
 
 
361 aa  96.3  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  28.86 
 
 
347 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  27.78 
 
 
345 aa  95.9  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  30.52 
 
 
341 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  30 
 
 
338 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  46 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  46 
 
 
334 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  36.47 
 
 
380 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  32 
 
 
379 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  29.74 
 
 
338 aa  94  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  38.96 
 
 
334 aa  93.6  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  29.03 
 
 
360 aa  93.2  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  40.35 
 
 
342 aa  92.8  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  30.46 
 
 
350 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  28.48 
 
 
352 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  31.1 
 
 
340 aa  92.8  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  43.33 
 
 
353 aa  92.4  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  28.57 
 
 
365 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  29.06 
 
 
361 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  31.77 
 
 
362 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  27.4 
 
 
347 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  29.82 
 
 
345 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  31.31 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  30.6 
 
 
344 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  29.57 
 
 
340 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  56.25 
 
 
343 aa  90.1  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  25.68 
 
 
343 aa  90.1  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  28.36 
 
 
337 aa  89.7  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  28.65 
 
 
340 aa  89.4  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  39.2 
 
 
382 aa  89.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  39.67 
 
 
352 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  36.96 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  29.52 
 
 
343 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  34.09 
 
 
355 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  38.19 
 
 
335 aa  89  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.65 
 
 
6889 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  34.34 
 
 
402 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  42.16 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  30.12 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  27.37 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  41.67 
 
 
396 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  42.16 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  36.15 
 
 
360 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  41.67 
 
 
396 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  28.3 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  29.1 
 
 
344 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  40 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  29.59 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.56 
 
 
340 aa  87  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  30.18 
 
 
355 aa  87  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  28.53 
 
 
340 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  27.67 
 
 
415 aa  86.7  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  32.5 
 
 
734 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  39.52 
 
 
330 aa  86.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  27.61 
 
 
367 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3067  Luciferase-like monooxygenase  32.42 
 
 
408 aa  85.9  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  28.57 
 
 
358 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>