26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0016 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0016  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  352  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0040  hypothetical protein  45.32 
 
 
192 aa  130  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3181  hypothetical protein  42.96 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1562  hypothetical protein  32.8 
 
 
180 aa  97.8  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7096  hypothetical protein  33.79 
 
 
172 aa  84.3  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0801  hypothetical protein  37.88 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2282  hypothetical protein  32.85 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2822  hypothetical protein  29.3 
 
 
162 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779408  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0281  hypothetical protein  25.64 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721924  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0299  hypothetical protein  30.15 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000250454 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5091  hypothetical protein  39.74 
 
 
157 aa  58.2  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1987  hypothetical protein  40.74 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6173  hypothetical protein  27.08 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1721  hypothetical protein  26.54 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3579  hypothetical protein  39.51 
 
 
153 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2986  hypothetical protein  29.58 
 
 
180 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000138173  normal  0.0479849 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2237  hypothetical protein  28.68 
 
 
151 aa  54.3  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1996  hypothetical protein  26.63 
 
 
181 aa  54.3  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6460  hypothetical protein  27.39 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2212  hypothetical protein  27.07 
 
 
158 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7095  hypothetical protein  29.8 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2877  hypothetical protein  28.91 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  26.45 
 
 
435 aa  44.3  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1791  hypothetical protein  26.77 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00490564  normal  0.234102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4624  hypothetical protein  34.52 
 
 
156 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2232  hypothetical protein  24.24 
 
 
157 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>