More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0005 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 394 aa  769    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  83.42 
 
 		 394 aa  625  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  72.22 
 
 		 396 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  72.73 
 
 		 396 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  53.32 
 
 		 419 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  53.57 
 
 		 405 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1566  major facilitator transporter  53.08 
 
 		 405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  48.8 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  48.72 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 420 aa  209  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 411 aa  199  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  34.78 
 
 		 411 aa  186  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 414 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 417 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  33.84 
 
 		 422 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  33.69 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 421 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 417 aa  149  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  33.51 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  32.96 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  25.74 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  25.74 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1166  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  25.74 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  25.74 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  27.88 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  27.88 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  25.74 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  27.92 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  26.81 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  27.51 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  27.51 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  27.51 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  24.9 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  27.51 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  26.45 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  27.51 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  25.37 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  26.45 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1603  major facilitator superfamily MFS_1  21.9 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  26.77 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  26.36 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  26.09 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  26.09 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2007  major facilitator transporter  25 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  21.48 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  24.25 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  24.64 
 
 		 436 aa  67  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 400 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1844  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2162  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0053  major facilitator transporter  25 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>