214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4180 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  66.4 
 
 
498 aa  665    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  66.4 
 
 
498 aa  665    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  67.61 
 
 
498 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  66.4 
 
 
498 aa  665    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  84.37 
 
 
499 aa  858    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  67.61 
 
 
498 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  66.4 
 
 
498 aa  665    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  100 
 
 
498 aa  1016    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  66 
 
 
498 aa  662    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  67.61 
 
 
498 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  67.61 
 
 
498 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  73.49 
 
 
499 aa  764    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  67.2 
 
 
498 aa  656    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  68.85 
 
 
512 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  75.3 
 
 
499 aa  775    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  68.85 
 
 
512 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  68.85 
 
 
512 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  66.4 
 
 
498 aa  665    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  66.4 
 
 
506 aa  665    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  66.4 
 
 
498 aa  665    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  69.08 
 
 
523 aa  655    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  67.4 
 
 
498 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  65.95 
 
 
468 aa  624  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  42.77 
 
 
546 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  42.83 
 
 
552 aa  391  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  42.13 
 
 
553 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  42.99 
 
 
553 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  47.19 
 
 
530 aa  276  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.48 
 
 
526 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  44.37 
 
 
543 aa  260  3e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  44.12 
 
 
560 aa  247  4e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.96 
 
 
528 aa  240  4e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  46.34 
 
 
509 aa  239  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  45.3 
 
 
509 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  47.04 
 
 
489 aa  233  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  39.17 
 
 
506 aa  209  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.34 
 
 
375 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  41.96 
 
 
464 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  47.65 
 
 
466 aa  204  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  41.83 
 
 
498 aa  200  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  41.58 
 
 
382 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  40.69 
 
 
547 aa  200  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.35 
 
 
389 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.09 
 
 
407 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  39.19 
 
 
376 aa  169  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.5 
 
 
477 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.08 
 
 
436 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.88 
 
 
382 aa  145  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  33.57 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.88 
 
 
387 aa  139  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.88 
 
 
383 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  33.85 
 
 
368 aa  109  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  32.65 
 
 
368 aa  107  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  34.29 
 
 
368 aa  103  9e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  35.75 
 
 
368 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  34.34 
 
 
379 aa  98.6  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  26.69 
 
 
332 aa  64.3  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  25.52 
 
 
309 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  23.51 
 
 
309 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.89 
 
 
302 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  24.57 
 
 
309 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  23.99 
 
 
302 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  24.07 
 
 
343 aa  58.9  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2227  hypothetical protein  25.17 
 
 
309 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.837362  hitchhiker  0.00000000223173 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2815  ATPase  23.51 
 
 
309 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  24.23 
 
 
309 aa  57.4  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  24.23 
 
 
309 aa  57.4  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.67 
 
 
319 aa  57.4  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  24.23 
 
 
309 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  23.95 
 
 
335 aa  57  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3053  hypothetical protein  24.14 
 
 
309 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.631245  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  26.13 
 
 
312 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  24.83 
 
 
316 aa  55.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  24.27 
 
 
332 aa  55.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.76 
 
 
326 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2735  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  23.89 
 
 
309 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  23.28 
 
 
335 aa  54.3  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  25.17 
 
 
340 aa  54.7  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  24.48 
 
 
318 aa  54.3  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.59 
 
 
333 aa  53.9  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.86 
 
 
350 aa  53.9  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2108  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.94 
 
 
285 aa  53.9  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.31 
 
 
334 aa  53.5  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.99 
 
 
319 aa  53.5  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  24.56 
 
 
340 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.39 
 
 
323 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.39 
 
 
323 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  27.53 
 
 
346 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.57 
 
 
306 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  24.23 
 
 
302 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  21.86 
 
 
315 aa  52.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.57 
 
 
306 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.67 
 
 
349 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  24.21 
 
 
318 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  19.93 
 
 
308 aa  52.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.66 
 
 
325 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  25.16 
 
 
321 aa  51.2  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.95 
 
 
351 aa  51.2  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  23.85 
 
 
324 aa  51.2  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  23.58 
 
 
349 aa  51.6  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>