91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4119 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  100 
 
 
482 aa  994  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  61.49 
 
 
452 aa  592  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  8.89729e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  54.33 
 
 
455 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  50.21 
 
 
449 aa  468  1e-130  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  36.58 
 
 
423 aa  288  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  35.1 
 
 
422 aa  276  5e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  33.81 
 
 
430 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  43.13 
 
 
437 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  29.76 
 
 
410 aa  150  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  26.55 
 
 
406 aa  142  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  29.15 
 
 
403 aa  142  2e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  64.84 
 
 
203 aa  139  9e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  26.67 
 
 
422 aa  133  8e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  25.81 
 
 
421 aa  130  4e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  38.73 
 
 
408 aa  128  2e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  28.13 
 
 
454 aa  116  7e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  32.86 
 
 
440 aa  107  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  36.42 
 
 
439 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  39.39 
 
 
410 aa  106  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  25.43 
 
 
427 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  25.47 
 
 
442 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  32.97 
 
 
445 aa  100  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  27.12 
 
 
478 aa  97.1  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  46.39 
 
 
420 aa  90.1  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  33.99 
 
 
464 aa  86.3  1e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  40.19 
 
 
415 aa  82.4  2e-14  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  32.74 
 
 
464 aa  78.6  3e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  38.46 
 
 
453 aa  76.3  1e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  38.89 
 
 
577 aa  75.1  2e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  38.32 
 
 
769 aa  75.9  2e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  28.93 
 
 
445 aa  73.9  5e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  47.3 
 
 
709 aa  72  2e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  31.65 
 
 
736 aa  72.4  2e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  35.65 
 
 
360 aa  70.1  8e-11  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  34.95 
 
 
414 aa  69.7  1e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1963  hypothetical protein  27.27 
 
 
265 aa  68.9  2e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  38.04 
 
 
418 aa  68.2  4e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  40.66 
 
 
619 aa  62.8  1e-08  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3230  hypothetical protein  43.06 
 
 
113 aa  59.7  1e-07  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0080421  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  58.5  2e-07  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  31.73 
 
 
588 aa  57.4  6e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  32.43 
 
 
532 aa  56.6  1e-06  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  28.79 
 
 
457 aa  55.8  1e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  30.05 
 
 
608 aa  55.5  2e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  33.7 
 
 
368 aa  55.8  2e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  28 
 
 
369 aa  55.1  3e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  34.41 
 
 
712 aa  55.1  3e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.98 
 
 
429 aa  54.7  3e-06  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  37.04 
 
 
452 aa  54.3  5e-06  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  33.96 
 
 
610 aa  53.5  7e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  29.25 
 
 
368 aa  53.5  8e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  23.81 
 
 
461 aa  53.1  1e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  24.1 
 
 
461 aa  52.8  1e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  28.7 
 
 
336 aa  53.1  1e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  31.07 
 
 
352 aa  51.2  4e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  23.33 
 
 
519 aa  50.1  8e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  27.05 
 
 
452 aa  50.4  8e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  31.07 
 
 
353 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.37 
 
 
594 aa  50.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.94 
 
 
708 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  35.82 
 
 
858 aa  47.8  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1018  hypothetical protein  31.82 
 
 
606 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88989e-33 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  33.75 
 
 
666 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  31.18 
 
 
601 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  34.78 
 
 
249 aa  46.6  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  30.88 
 
 
623 aa  46.6  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.55 
 
 
652 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  25.66 
 
 
450 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  23.78 
 
 
584 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  30.43 
 
 
976 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  27.57 
 
 
443 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  27.61 
 
 
582 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1783  hypothetical protein  28.75 
 
 
447 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  34.09 
 
 
708 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4877  AAA ATPase  32.5 
 
 
591 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0546065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  36.07 
 
 
250 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.80091e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  42.22 
 
 
670 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0155  AAA ATPase  27.87 
 
 
544 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.754147  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  24.38 
 
 
429 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  29.55 
 
 
228 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  38.3 
 
 
176 aa  44.3  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  37.35 
 
 
530 aa  43.9  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  31.68 
 
 
416 aa  43.5  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  22.05 
 
 
427 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  34.78 
 
 
284 aa  43.5  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.41201e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  26.89 
 
 
251 aa  43.5  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0007  AAA ATPase  27.71 
 
 
380 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  37.31 
 
 
250 aa  43.5  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  27.07 
 
 
1162 aa  43.1  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0003  recombination protein F  30.83 
 
 
364 aa  43.1  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  26.96 
 
 
533 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>